31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0851 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0878  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 
72 aa  144  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.336866  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0851  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 
72 aa  144  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1108  hypothetical protein  55.38 
 
 
84 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  36.07 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  36.07 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4380  protein of unknown function UPF0150  60.42 
 
 
75 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000434558  unclonable  0.0000000015436 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1442  hypothetical protein  50 
 
 
68 aa  47  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1293  hypothetical protein  52 
 
 
73 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.598885  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 
134 aa  45.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  32.31 
 
 
74 aa  44.7  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2966  protein of unknown function UPF0150  52 
 
 
75 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.402852  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2122  hypothetical protein  42.55 
 
 
72 aa  43.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00580753  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4318  protein of unknown function UPF0150  54.35 
 
 
51 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2236  protein of unknown function UPF0150  44 
 
 
73 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785928  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  52.5 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0001  protein of unknown function UPF0150  44 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2716  hypothetical protein  47.06 
 
 
73 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.287046  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1938  hypothetical protein  49.02 
 
 
73 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000211711  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1511  hypothetical protein  38.46 
 
 
72 aa  41.6  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  46.51 
 
 
67 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1504  hypothetical protein  38.46 
 
 
72 aa  41.6  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00554822  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1470  hypothetical protein  38.46 
 
 
72 aa  41.6  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1463  hypothetical protein  38.46 
 
 
75 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  46.51 
 
 
67 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  38.78 
 
 
74 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  38.78 
 
 
74 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2120  hypothetical protein  50 
 
 
81 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0129821  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2670  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.158684 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4509  protein of unknown function UPF0150  47.5 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2553  hypothetical protein  41.46 
 
 
75 aa  40.4  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0369521  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  45.45 
 
 
71 aa  40.8  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>