29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2670 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2670  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 		 69 aa  138  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.158684 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1441  protein of unknown function UPF0150  68.12 
 
 		 69 aa  101  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0633487  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1511  hypothetical protein  48.48 
 
 		 72 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1504  hypothetical protein  48.48 
 
 		 72 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00554822  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1470  hypothetical protein  48.48 
 
 		 72 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1463  hypothetical protein  48.48 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0620  hypothetical protein  46.88 
 
 		 72 aa  55.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0981  protein of unknown function UPF0150  42.86 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000496376  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2122  hypothetical protein  46.38 
 
 		 72 aa  53.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00580753  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1149  hypothetical protein  39.39 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3688  hypothetical protein  39.39 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148975  hitchhiker  0.00946321 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1108  hypothetical protein  43.75 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0500  hypothetical protein  60.61 
 
 		 85 aa  47.4  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.187258  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  42.86 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0554  hypothetical protein  36.36 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0483  hypothetical protein  33.33 
 
 		 73 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.243945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2120  hypothetical protein  50 
 
 		 81 aa  41.6  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0129821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0248  hypothetical protein  38.33 
 
 		 64 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.209106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  46.43 
 
 		 137 aa  41.2  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0851  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0878  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.336866  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  37.29 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  43.18 
 
 		 74 aa  40.4  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2369  hypothetical protein  39.68 
 
 		 80 aa  40.4  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00651332  normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  31.82 
 
 		 74 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2966  protein of unknown function UPF0150  47.06 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.402852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  32.26 
 
 		 79 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  32.31 
 
 		 74 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  32.26 
 
 		 79 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>