52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2553 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2553  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0369521  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0210  protein of unknown function UPF0150  43.48 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0206  protein of unknown function UPF0150  43.48 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139417 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0001  protein of unknown function UPF0150  45.83 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4509  protein of unknown function UPF0150  45.83 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  47.62 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  53.33 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  51.11 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2363  hypothetical protein  51.11 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.555585  normal  0.0574979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  45.65 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1009  hypothetical protein  52.63 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000893941  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  45.45 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  51.35 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  51.35 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  51.35 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  51.35 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  51.35 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  38.64 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  48.65 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  46.67 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  42.22 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  42.22 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  41.67 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1797  hypothetical protein  47.22 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  48.72 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  45 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  47.73 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  37.78 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  41.67 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0600  hypothetical protein  50 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  45 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  46.15 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1442  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  42  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  31.48 
 
 		 147 aa  41.2  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2115  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  51.43 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  51.28 
 
 		 138 aa  41.2  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  33.33 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1234  protein of unknown function UPF0150  45.45 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1241  hypothetical protein  48.48 
 
 		 55 aa  41.2  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0851  protein of unknown function UPF0150  41.46 
 
 		 72 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0878  protein of unknown function UPF0150  41.46 
 
 		 72 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.336866  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  36.96 
 
 		 122 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  54.84 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  35.71 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  54.84 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  33.9 
 
 		 130 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  48.78 
 
 		 72 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  48.78 
 
 		 72 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>