78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1009 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1009  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  148  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000893941  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2115  protein of unknown function UPF0150  50.75 
 
 		 68 aa  73.9  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  48.48 
 
 		 68 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  48.48 
 
 		 68 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1541  hypothetical protein  75 
 
 		 56 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1241  hypothetical protein  54.55 
 
 		 55 aa  65.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1234  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  62 
 
 		 68 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  62 
 
 		 68 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  58.7 
 
 		 72 aa  60.5  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  48.33 
 
 		 75 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  42.65 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  48 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  51.92 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  51.92 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0712  hypothetical protein  54 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  46.43 
 
 		 72 aa  56.6  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0717  hypothetical protein  52 
 
 		 57 aa  56.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.810179  normal  0.0354366 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  44.78 
 
 		 71 aa  55.1  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  54.17 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2363  hypothetical protein  54.17 
 
 		 72 aa  52  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.555585  normal  0.0574979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  43.08 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  40.68 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0719  hypothetical protein  51.16 
 
 		 87 aa  50.1  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.08984  normal  0.0479916 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0443  protein of unknown function UPF0150  49.18 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0276188 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0670  hypothetical protein  45.1 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.720771  normal  0.417071 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  46.81 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  46.81 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0620  hypothetical protein  47.92 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1442  hypothetical protein  52.27 
 
 		 68 aa  48.9  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0001  protein of unknown function UPF0150  44.68 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0206  protein of unknown function UPF0150  42.59 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139417 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0210  protein of unknown function UPF0150  42.59 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4509  protein of unknown function UPF0150  44.68 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2648  hypothetical protein  44.68 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2553  hypothetical protein  52.63 
 
 		 75 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0369521  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4580  hypothetical protein  32.76 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.520083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1108  hypothetical protein  44.9 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1176  protein of unknown function UPF0150  41.86 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  41.82 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  40.3 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  40 
 
 		 72 aa  44.3  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  42.59 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  46 
 
 		 74 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  40.3 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  50 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  37.5 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0554  hypothetical protein  45.24 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0797  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  50 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0585  hypothetical protein  42.86 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290955  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  43.18 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1435  hypothetical protein  30.36 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.374935  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3101  hypothetical protein  47.83 
 
 		 56 aa  42  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.031062  normal  0.0887922 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  44.26 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  40.38 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  38.46 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0153  hypothetical protein  45.45 
 
 		 70 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 136 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  40.74 
 
 		 74 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1593  protein of unknown function UPF0150  40.38 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  40.74 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1008  hypothetical protein  33.93 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  47.83 
 
 		 150 aa  41.2  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  43.14 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2639  protein of unknown function UPF0150  38 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0248  hypothetical protein  33.96 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.209106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2006  protein of unknown function UPF0150  43.75 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0639665  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1149  hypothetical protein  38.1 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  52.78 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0609  hypothetical protein  40 
 
 		 74 aa  40.8  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000794304  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2369  hypothetical protein  33.33 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00651332  normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0600  hypothetical protein  33.33 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>