62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0670 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0670  hypothetical protein  100 
 
 
78 aa  157  4e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.720771  normal  0.417071 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  80 
 
 
72 aa  94.7  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  46.67 
 
 
74 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  57.45 
 
 
72 aa  60.1  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  52.17 
 
 
75 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  58.54 
 
 
78 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3101  hypothetical protein  61.54 
 
 
56 aa  56.6  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.031062  normal  0.0887922 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1234  protein of unknown function UPF0150  45.83 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2115  protein of unknown function UPF0150  54 
 
 
68 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0620  hypothetical protein  41.67 
 
 
72 aa  50.8  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  43.4 
 
 
72 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  43.4 
 
 
72 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  44.9 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  44.44 
 
 
71 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1009  hypothetical protein  45.1 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000893941  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  44.9 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  51.06 
 
 
74 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  43.66 
 
 
75 aa  48.1  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  51.06 
 
 
74 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  50 
 
 
72 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0719  hypothetical protein  37.7 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.08984  normal  0.0479916 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2363  hypothetical protein  50 
 
 
72 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.555585  normal  0.0574979 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2122  hypothetical protein  42 
 
 
72 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00580753  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0483  hypothetical protein  45.65 
 
 
73 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.243945  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  45.1 
 
 
130 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  40.74 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  41.51 
 
 
134 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  44 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  41.18 
 
 
67 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  44 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1797  hypothetical protein  47.06 
 
 
74 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2369  hypothetical protein  41.51 
 
 
80 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00651332  normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  37.04 
 
 
72 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  43.14 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  44.68 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0010  hypothetical protein  38.6 
 
 
86 aa  44.7  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.324673  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  37.29 
 
 
139 aa  44.7  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  41.51 
 
 
79 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  48.65 
 
 
135 aa  44.3  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  41.51 
 
 
79 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0600  hypothetical protein  38.89 
 
 
70 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  42.22 
 
 
138 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 
134 aa  43.9  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0585  hypothetical protein  41.51 
 
 
69 aa  43.9  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290955  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  38 
 
 
75 aa  43.5  0.0009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  37.31 
 
 
137 aa  43.5  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1108  hypothetical protein  41.54 
 
 
84 aa  42.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1059  hypothetical protein  30.99 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1541  hypothetical protein  44.74 
 
 
56 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4876  hypothetical protein  37.1 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  42.55 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  40.38 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0021  hypothetical protein  45.1 
 
 
72 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.317209  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  55.88 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0712  hypothetical protein  32.2 
 
 
117 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1176  protein of unknown function UPF0150  32.65 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  37.25 
 
 
72 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  38.3 
 
 
132 aa  40.4  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  41.67 
 
 
74 aa  40.8  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0019  protein of unknown function UPF0150  37.74 
 
 
93 aa  40.4  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0272418  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1721  CopG family DNA-binding protein  37.5 
 
 
119 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337055  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  37.25 
 
 
98 aa  40  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>