46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3101 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_3101  hypothetical protein  100 
 
 
56 aa  113  8.999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.031062  normal  0.0887922 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  66.07 
 
 
72 aa  79  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0670  hypothetical protein  61.54 
 
 
78 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.720771  normal  0.417071 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  44.44 
 
 
72 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  63.41 
 
 
75 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1797  hypothetical protein  47.17 
 
 
74 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0585  hypothetical protein  47.06 
 
 
69 aa  52  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290955  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  63.89 
 
 
78 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1241  hypothetical protein  47.83 
 
 
55 aa  48.9  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2369  hypothetical protein  43.75 
 
 
80 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00651332  normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  37.04 
 
 
75 aa  47.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4282  hypothetical protein  45.45 
 
 
75 aa  47.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.674146  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  59.46 
 
 
67 aa  47  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  65.71 
 
 
68 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  50 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  53.66 
 
 
137 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  65.71 
 
 
68 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  60.53 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  60.53 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  51.28 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  52.63 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  53.85 
 
 
69 aa  45.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  55.26 
 
 
72 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  55.26 
 
 
72 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  45.1 
 
 
150 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  52.78 
 
 
70 aa  43.9  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  40 
 
 
132 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2115  protein of unknown function UPF0150  45.65 
 
 
68 aa  44.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  51.28 
 
 
136 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 
68 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 
68 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  60.61 
 
 
72 aa  43.5  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  48.72 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1009  hypothetical protein  47.83 
 
 
76 aa  42  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000893941  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  48.72 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  39.47 
 
 
135 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2363  hypothetical protein  58.33 
 
 
72 aa  41.6  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.555585  normal  0.0574979 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  41.18 
 
 
145 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4214  hypothetical protein  44.74 
 
 
68 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0600  hypothetical protein  39.22 
 
 
70 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  58.33 
 
 
72 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  41.03 
 
 
68 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  46.34 
 
 
98 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  44.74 
 
 
134 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 
71 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 
71 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>