110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2528 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  48.31 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  51.47 
 
 		 130 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3280  hypothetical protein  44.68 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  42.68 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  38.95 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  50 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  44.58 
 
 		 93 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  49.21 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4022  protein of unknown function UPF0150  43.01 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  47.54 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  40.85 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  37.14 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  36.67 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  43.48 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  46.38 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2022  hypothetical protein  42.55 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125312 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  46.67 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  32.53 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  44.29 
 
 		 136 aa  63.5  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  44.93 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  46.15 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  42.25 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  43.48 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  39.06 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  39.06 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  34.57 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  47.46 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  45.76 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  44.26 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  46.55 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0010  hypothetical protein  35.21 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.324673  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3369  hypothetical protein  42.53 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  38.46 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  53.66 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  44.26 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 		 75 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2598  hypothetical protein  27.06 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0800472  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  42.19 
 
 		 69 aa  53.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  43.1 
 
 		 70 aa  52  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  34.57 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  40.51 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  43.1 
 
 		 79 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  43.1 
 
 		 79 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  32.81 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4060  protein of unknown function UPF0150  39.06 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  44.83 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  34.78 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0585  hypothetical protein  38.89 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290955  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  34.52 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  39.29 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3129  protein of unknown function UPF0150  37.5 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.28092 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  37.5 
 
 		 78 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1450  protein of unknown function UPF0150  40.38 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1797  hypothetical protein  40 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1945  protein of unknown function UPF0150  31.03 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1957  protein of unknown function UPF0150  31.03 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516123 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0019  protein of unknown function UPF0150  40.32 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0272418  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  33.85 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3342  hypothetical protein  37.68 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.589243  normal  0.0213598 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  38.18 
 
 		 72 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  38.18 
 
 		 72 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  41.51 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  37.7 
 
 		 75 aa  47  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2748  CopG family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  32.89 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0443  protein of unknown function UPF0150  45 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0276188 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1721  CopG family DNA-binding protein  34.12 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337055  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  38.1 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  33.82 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  37.31 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  37.31 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  37.31 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  34.43 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2027  protein of unknown function UPF0150  46.67 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000026815  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  44.9 
 
 		 72 aa  45.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1407  hypothetical protein  39.71 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  37.88 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1837  hypothetical protein  29.58 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4282  hypothetical protein  38 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.674146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  36.84 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  40.82 
 
 		 118 aa  43.9  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  30.67 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  36.84 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  35.48 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  29.41 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0299  hypothetical protein  40 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.046828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1593  protein of unknown function UPF0150  27.59 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3215  protein of unknown function UPF0150  34.38 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304622 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2369  hypothetical protein  32.76 
 
 		 80 aa  43.5  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00651332  normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2178  hypothetical protein  33.33 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0609  hypothetical protein  29.51 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000794304  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0670  hypothetical protein  42.55 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.720771  normal  0.417071 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  32.14 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4316  protein of unknown function UPF0150  47.5 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4378  protein of unknown function UPF0150  47.5 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000452582  unclonable  0.00000000142401 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  32.26 
 
 		 121 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4214  hypothetical protein  35.59 
 
 		 68 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>