48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1450 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1450  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 
133 aa  276  5e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  57.14 
 
 
138 aa  166  7e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3434  hypothetical protein  46.56 
 
 
137 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141009  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3513  hypothetical protein  46.92 
 
 
140 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474161  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3792  hypothetical protein  46.92 
 
 
140 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0190281  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3432  hypothetical protein  44.62 
 
 
140 aa  134  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000618891  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  43.61 
 
 
139 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  41.22 
 
 
135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1551  hypothetical protein  41.09 
 
 
129 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2253  hypothetical protein  33.07 
 
 
138 aa  94  6e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0842095  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  36.72 
 
 
124 aa  87.4  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3797  hypothetical protein  33.09 
 
 
140 aa  84  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2027  protein of unknown function UPF0150  38.17 
 
 
135 aa  83.6  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000026815  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  42.71 
 
 
98 aa  83.2  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  33.59 
 
 
130 aa  82  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1837  hypothetical protein  33.33 
 
 
134 aa  79  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2094  protein of unknown function UPF0150  30 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000245077  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1835  hypothetical protein  29.32 
 
 
134 aa  67.8  0.00000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000086332  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0010  hypothetical protein  32.43 
 
 
86 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.324673  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  26.56 
 
 
139 aa  55.5  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0019  protein of unknown function UPF0150  44.44 
 
 
93 aa  54.7  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0272418  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  36.51 
 
 
70 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  27.48 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  45.65 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  40.38 
 
 
98 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  38.67 
 
 
96 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  25.78 
 
 
130 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  34.62 
 
 
134 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  37.93 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  24.8 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  29.35 
 
 
132 aa  43.5  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0600  hypothetical protein  29.23 
 
 
70 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  41.38 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  32.18 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  28.3 
 
 
136 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  36.73 
 
 
75 aa  42  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  34.92 
 
 
71 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  34.92 
 
 
71 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  30 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  34.88 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  41.86 
 
 
131 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  26.15 
 
 
134 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  40.4  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  32.31 
 
 
136 aa  40.4  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0802  hypothetical protein  31.25 
 
 
80 aa  40  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.376551  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  35.48 
 
 
72 aa  40  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>