63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1635 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  276  7e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  75.94 
 
 		 134 aa  221  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  46.27 
 
 		 137 aa  121  3e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  44.44 
 
 		 136 aa  117  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  46.21 
 
 		 136 aa  116  9e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  38.35 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 134 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  39.55 
 
 		 136 aa  101  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  35.11 
 
 		 134 aa  99.4  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 136 aa  99.4  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  36.36 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  36.15 
 
 		 131 aa  87.8  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  36.15 
 
 		 137 aa  86.7  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2598  hypothetical protein  33.57 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0800472  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  32.33 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  34.88 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  32.33 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  32.58 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  30.08 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  32.85 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  29.85 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  32.84 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  29.37 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  34.65 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  35.38 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2305  hypothetical protein  34.07 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0042  hypothetical protein  32.33 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.567863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  32.09 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  29.51 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4680  hypothetical protein  34.4 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  31.34 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  29.55 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4409  hypothetical protein  33.6 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.901332 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  28.23 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4601  hypothetical protein  33.6 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0107991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4418  hypothetical protein  33.6 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200049  normal  0.0150185 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4580  hypothetical protein  33.6 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0417201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  30.37 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  30.37 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  30.37 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  27.56 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  30.71 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  29.46 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  27.94 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4060  protein of unknown function UPF0150  26.87 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3342  hypothetical protein  28.57 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.589243  normal  0.0213598 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1721  CopG family DNA-binding protein  33.72 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337055  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0032  hypothetical protein  32 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.475298  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  33.82 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  28.93 
 
 		 129 aa  47  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3215  protein of unknown function UPF0150  30 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304622 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  34.29 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1957  protein of unknown function UPF0150  31.67 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516123 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2178  hypothetical protein  33.87 
 
 		 72 aa  42.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1945  protein of unknown function UPF0150  31.67 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4121  protein of unknown function UPF0150  30 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0651  protein of unknown function UPF0150  32.31 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  37.29 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4161  protein of unknown function UPF0150  30 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.49192 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  35.82 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1361  transcriptional regulator, XRE family  28.12 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00209269  hitchhiker  6.37946e-19 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  30.3 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>