64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4282 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4282  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  154  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.674146  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  71.7 
 
 
70 aa  84  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4214  hypothetical protein  68.52 
 
 
68 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0585  hypothetical protein  61.82 
 
 
69 aa  75.1  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290955  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  62.96 
 
 
68 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3129  protein of unknown function UPF0150  60.38 
 
 
68 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.28092 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  58.49 
 
 
75 aa  70.5  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  58.49 
 
 
69 aa  70.1  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2369  hypothetical protein  54.55 
 
 
80 aa  68.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00651332  normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0600  hypothetical protein  56.36 
 
 
70 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  51.85 
 
 
72 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  59.26 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1797  hypothetical protein  50 
 
 
74 aa  63.5  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  52.08 
 
 
71 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  52.08 
 
 
71 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  51.85 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1629  hypothetical protein  58.33 
 
 
69 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0802  hypothetical protein  46.3 
 
 
80 aa  57  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.376551  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  44 
 
 
130 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4389  hypothetical protein  57.14 
 
 
81 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.400266  normal  0.0706735 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  44.44 
 
 
108 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  54.17 
 
 
71 aa  53.5  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  40 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  43.64 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  45.45 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  50 
 
 
74 aa  52.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  40 
 
 
131 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  40.74 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  42.86 
 
 
136 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  52.17 
 
 
74 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  42.86 
 
 
136 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  52.17 
 
 
74 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  41.51 
 
 
135 aa  50.4  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  39.22 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  46.94 
 
 
136 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  42.86 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  46.94 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  38.33 
 
 
79 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  38.33 
 
 
79 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3101  hypothetical protein  45.45 
 
 
56 aa  47.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.031062  normal  0.0887922 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  38.33 
 
 
72 aa  47.4  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  43.75 
 
 
129 aa  47  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  45.45 
 
 
130 aa  47  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  37.25 
 
 
139 aa  47  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  45.45 
 
 
137 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  40 
 
 
150 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  44.9 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  45.28 
 
 
67 aa  44.7  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  50 
 
 
137 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0592  hypothetical protein  42.55 
 
 
69 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  38 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  43.14 
 
 
99 aa  43.5  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  44.19 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  42.22 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2967  hypothetical protein  40.74 
 
 
64 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.436183  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  37.5 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  38.89 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  44.23 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2122  hypothetical protein  44.9 
 
 
72 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00580753  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  38 
 
 
132 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  42.31 
 
 
75 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0210  protein of unknown function UPF0150  40.43 
 
 
68 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0206  protein of unknown function UPF0150  40.43 
 
 
68 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139417 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  38.18 
 
 
121 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.663514 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>