67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2095 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  274  3e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  49.24 
 
 
130 aa  132  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3342  hypothetical protein  51.11 
 
 
131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.589243  normal  0.0213598 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4060  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 
131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2748  CopG family transcriptional regulator  48.46 
 
 
131 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1407  hypothetical protein  47.69 
 
 
131 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  38.52 
 
 
131 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  37.98 
 
 
135 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  37.31 
 
 
132 aa  82  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  34.38 
 
 
132 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  35.88 
 
 
136 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  35.88 
 
 
131 aa  70.1  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  35.88 
 
 
136 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  34.33 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  33.59 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  33.82 
 
 
129 aa  67  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  34.06 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  30.4 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  33.81 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  33.33 
 
 
134 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  37.9 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  28.57 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  37.9 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  37.9 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  32.09 
 
 
134 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  32.35 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  33.81 
 
 
136 aa  59.7  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  35.29 
 
 
128 aa  58.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  32.48 
 
 
135 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  28.12 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  33.58 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  33.09 
 
 
136 aa  57.4  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  30.15 
 
 
134 aa  57  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  34.31 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  42.47 
 
 
99 aa  53.9  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0042  hypothetical protein  29.2 
 
 
145 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.567863  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  34.38 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  29.01 
 
 
130 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  28.87 
 
 
138 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  30.3 
 
 
137 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4282  hypothetical protein  39.22 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.674146  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3280  hypothetical protein  44 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2305  hypothetical protein  28.03 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  27.34 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  37.5 
 
 
96 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  27.01 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 
71 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 
71 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2122  hypothetical protein  36.54 
 
 
72 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00580753  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  28.47 
 
 
138 aa  47  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  43.1 
 
 
93 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  34.72 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  45.24 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  29.31 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0134  hypothetical protein  27.78 
 
 
132 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501544  normal  0.0368693 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  40.48 
 
 
70 aa  43.9  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  32.2 
 
 
72 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0141  hypothetical protein  51.28 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1835  hypothetical protein  28.8 
 
 
134 aa  42  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000086332  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  39.13 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  36.36 
 
 
74 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  48.39 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  36.92 
 
 
68 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3760  hypothetical protein  23.31 
 
 
140 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0483  hypothetical protein  28.57 
 
 
73 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.243945  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  29.32 
 
 
118 aa  40  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4214  hypothetical protein  32.14 
 
 
68 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>