112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2487 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 
71 aa  144  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 
71 aa  144  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  46.27 
 
 
69 aa  66.2  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  39.13 
 
 
70 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3129  protein of unknown function UPF0150  37.88 
 
 
68 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.28092 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  41.27 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  43.94 
 
 
131 aa  62.8  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  43.33 
 
 
68 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0585  hypothetical protein  40.3 
 
 
69 aa  62  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290955  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  38.81 
 
 
75 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  40.98 
 
 
132 aa  61.6  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0802  hypothetical protein  43.48 
 
 
80 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.376551  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4282  hypothetical protein  52.08 
 
 
75 aa  61.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.674146  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  46.67 
 
 
142 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  39.06 
 
 
98 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1797  hypothetical protein  39.13 
 
 
74 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  62.79 
 
 
78 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4214  hypothetical protein  40 
 
 
68 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  41.38 
 
 
131 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  54.17 
 
 
137 aa  57.4  0.00000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  44.62 
 
 
75 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  35.82 
 
 
72 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  45.31 
 
 
96 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  41.54 
 
 
135 aa  57  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  41.67 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  44.44 
 
 
71 aa  56.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  41.67 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  47.37 
 
 
75 aa  54.7  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2369  hypothetical protein  38.98 
 
 
80 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00651332  normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  44.44 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  50 
 
 
74 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  40.35 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  41.67 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  49.15 
 
 
68 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  49.15 
 
 
68 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  43.86 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0600  hypothetical protein  38.98 
 
 
70 aa  51.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  43.86 
 
 
136 aa  52  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  56.82 
 
 
72 aa  51.6  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  41.43 
 
 
79 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  42.62 
 
 
136 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  41.43 
 
 
79 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  38.57 
 
 
129 aa  50.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  39.34 
 
 
136 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2122  hypothetical protein  41.79 
 
 
72 aa  50.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00580753  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  35.48 
 
 
69 aa  50.8  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  52.27 
 
 
133 aa  50.8  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 
74 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 
74 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  51.22 
 
 
138 aa  50.4  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  33.9 
 
 
135 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  41.38 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  47.83 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  40.68 
 
 
74 aa  49.3  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  41.79 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  38.33 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4389  hypothetical protein  42.22 
 
 
81 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.400266  normal  0.0706735 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  42.31 
 
 
67 aa  47.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  45.76 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  35.71 
 
 
108 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  40 
 
 
134 aa  47  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1629  hypothetical protein  36.36 
 
 
69 aa  47  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  35.09 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1973  hypothetical protein  47.62 
 
 
71 aa  45.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.193383  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1740  hypothetical protein  44.07 
 
 
66 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0186698  normal 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0021  hypothetical protein  43.86 
 
 
72 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.317209  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  44.44 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  40.62 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  47.73 
 
 
71 aa  45.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0299  hypothetical protein  47.06 
 
 
113 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.046828  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  35.59 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  37.5 
 
 
130 aa  44.7  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  40.82 
 
 
72 aa  45.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  30.36 
 
 
137 aa  44.7  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 
121 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  46.94 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1496  protein of unknown function UPF0150  41.51 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815263  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0572  hypothetical protein  39.13 
 
 
187 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000321015  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  40 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1593  protein of unknown function UPF0150  42.86 
 
 
70 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1469  protein of unknown function UPF0150  41.51 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  32.2 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  38.6 
 
 
98 aa  42.7  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2598  hypothetical protein  36.21 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0800472  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0483  hypothetical protein  39.34 
 
 
73 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.243945  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  38.71 
 
 
72 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0376  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.586857  normal  0.0103099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  40.38 
 
 
72 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  38.71 
 
 
72 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3111  hypothetical protein  37.5 
 
 
97 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.423352  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1463  hypothetical protein  42 
 
 
75 aa  41.6  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1470  hypothetical protein  42 
 
 
72 aa  41.6  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  29.82 
 
 
135 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  29.82 
 
 
135 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  29.82 
 
 
135 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1504  hypothetical protein  42 
 
 
72 aa  41.6  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00554822  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1511  hypothetical protein  42 
 
 
72 aa  41.6  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>