154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2675 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 		 131 aa  261  3e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  61.54 
 
 		 137 aa  163  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  54.69 
 
 		 130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  49.25 
 
 		 142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  45.8 
 
 		 136 aa  116  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  47.33 
 
 		 136 aa  116  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  43.41 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  40.77 
 
 		 137 aa  114  6e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  42.54 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 134 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  38.17 
 
 		 134 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  40.15 
 
 		 138 aa  97.8  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  40.15 
 
 		 145 aa  96.7  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  39.69 
 
 		 135 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  41.98 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  36.8 
 
 		 136 aa  92  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  36 
 
 		 136 aa  91.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  36.15 
 
 		 134 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  35.38 
 
 		 134 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  40.31 
 
 		 131 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  35.11 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  45.35 
 
 		 99 aa  84  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  33.59 
 
 		 133 aa  82  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  36.64 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  35.71 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  37.12 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  38.17 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  37.4 
 
 		 130 aa  76.6  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  37.5 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2598  hypothetical protein  29.77 
 
 		 140 aa  72  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0800472  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4060  protein of unknown function UPF0150  34.11 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  35.88 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3342  hypothetical protein  33.58 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.589243  normal  0.0213598 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  35.43 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  32.59 
 
 		 135 aa  67  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  32.59 
 
 		 135 aa  67  0.00000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  32.59 
 
 		 135 aa  67  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2748  CopG family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  46.48 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  36.89 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  32.54 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1407  hypothetical protein  37.29 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  43.94 
 
 		 71 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  43.94 
 
 		 71 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  35.71 
 
 		 129 aa  62  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4680  hypothetical protein  35.29 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  50 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  40.68 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  40.91 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  33.01 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  41.27 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  44.29 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  29.46 
 
 		 118 aa  57  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  27.52 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0572  hypothetical protein  28.24 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000321015  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1957  protein of unknown function UPF0150  38.71 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516123 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3760  hypothetical protein  32.06 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  27.56 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  27.59 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  27.59 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1973  hypothetical protein  39.34 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.193383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  46.77 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1945  protein of unknown function UPF0150  37.1 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  38.98 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  38.98 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  44.44 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4282  hypothetical protein  43.64 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.674146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  30.85 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  38.6 
 
 		 138 aa  52  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  34.85 
 
 		 124 aa  52  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1551  hypothetical protein  31.93 
 
 		 129 aa  52  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2305  hypothetical protein  28.24 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0376  protein of unknown function UPF0150  37.5 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.586857  normal  0.0103099 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4580  hypothetical protein  31.62 
 
 		 151 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0417201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1953  protein of unknown function UPF0150  39.34 
 
 		 69 aa  51.6  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0609  hypothetical protein  40 
 
 		 74 aa  51.6  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000794304  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4409  hypothetical protein  31.62 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.901332 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4418  hypothetical protein  31.62 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200049  normal  0.0150185 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1593  protein of unknown function UPF0150  36.07 
 
 		 70 aa  51.6  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4601  hypothetical protein  31.62 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0107991  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0032  hypothetical protein  31.62 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.475298  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  48.15 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  41.27 
 
 		 122 aa  50.1  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  32.79 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  42.86 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  36.51 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2300  hypothetical protein  38.1 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0481  hypothetical protein  26.61 
 
 		 113 aa  48.9  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000325611  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  38.71 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3887  hypothetical protein  25.76 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  38.33 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  39.06 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4214  hypothetical protein  39.06 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  41.38 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  27.91 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1721  CopG family DNA-binding protein  34.18 
 
 		 119 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337055  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0585  hypothetical protein  40.32 
 
 		 69 aa  47.8  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290955  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5266  hypothetical protein  24 
 
 		 150 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5593  hypothetical protein  24 
 
 		 150 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0042  hypothetical protein  31.5 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.567863  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>