137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1396 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  282  1.0000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  57.35 
 
 		 136 aa  168  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  55.88 
 
 		 136 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  53.08 
 
 		 136 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  48.91 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  48.15 
 
 		 134 aa  131  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  50.77 
 
 		 136 aa  130  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  46.27 
 
 		 134 aa  121  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  49.22 
 
 		 142 aa  120  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  41.35 
 
 		 137 aa  114  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  40.77 
 
 		 131 aa  114  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  41.48 
 
 		 145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  42.22 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  45.38 
 
 		 134 aa  106  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  41.91 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  41.18 
 
 		 132 aa  104  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  38.97 
 
 		 137 aa  102  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  38.52 
 
 		 138 aa  100  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2598  hypothetical protein  38.93 
 
 		 140 aa  95.9  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0800472  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  38.69 
 
 		 132 aa  94.7  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  41.01 
 
 		 135 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  41.01 
 
 		 135 aa  91.3  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  41.01 
 
 		 135 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  37.96 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  39.37 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4680  hypothetical protein  38.73 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4418  hypothetical protein  39.33 
 
 		 151 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200049  normal  0.0150185 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4601  hypothetical protein  39.33 
 
 		 151 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0107991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4409  hypothetical protein  39.33 
 
 		 151 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.901332 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0032  hypothetical protein  38.46 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.475298  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4580  hypothetical protein  38.78 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0417201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  47.13 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  37.69 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  34.35 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2305  hypothetical protein  34.81 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  37.5 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0042  hypothetical protein  35.42 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.567863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  36.67 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  48.39 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  38.02 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  33.81 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  33.6 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  30.56 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  31.11 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1721  CopG family DNA-binding protein  44.59 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337055  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  54.17 
 
 		 71 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  54.17 
 
 		 71 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3342  hypothetical protein  32.86 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.589243  normal  0.0213598 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  31.62 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  44.44 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  45.61 
 
 		 74 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  39.13 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  45.9 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  55.56 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  35.48 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  40.62 
 
 		 118 aa  51.2  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2748  CopG family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  53.06 
 
 		 75 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4060  protein of unknown function UPF0150  30.37 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  31.88 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1407  hypothetical protein  30.71 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  39.06 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  41.38 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  29.63 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  44.44 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  33.71 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0481  hypothetical protein  43.75 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000325611  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  53.19 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  42.86 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  32.26 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  39.34 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  38.16 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0802  hypothetical protein  42.62 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.376551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  55 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  29.25 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  28.97 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  34.33 
 
 		 69 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  38.81 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  32.26 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  45.28 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2363  hypothetical protein  45.28 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.555585  normal  0.0574979 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0299  hypothetical protein  48.15 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.046828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0134  hypothetical protein  39.68 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501544  normal  0.0368693 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2300  hypothetical protein  40.98 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  31.07 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4282  hypothetical protein  44.9 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.674146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  35.48 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2639  protein of unknown function UPF0150  42.86 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  43.18 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1945  protein of unknown function UPF0150  40.68 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1957  protein of unknown function UPF0150  40.68 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516123 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  35.29 
 
 		 74 aa  44.3  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  41.51 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  44.9 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1797  hypothetical protein  38.98 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1009  hypothetical protein  50 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000893941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>