50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2305 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2305  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  290  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  53.38 
 
 		 137 aa  148  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 134 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  36.09 
 
 		 135 aa  89.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  36.09 
 
 		 135 aa  89.4  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  36.09 
 
 		 135 aa  89.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  38.06 
 
 		 136 aa  84.3  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  37.5 
 
 		 136 aa  84  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  34.65 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  34.81 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  33.82 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  36.72 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2598  hypothetical protein  31.85 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0800472  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  33.82 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  34.56 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  34.07 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  39.84 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  32.06 
 
 		 137 aa  67  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  34.07 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0042  hypothetical protein  35.4 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.567863  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  30.47 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  34.81 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  33.82 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  33.86 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  32.59 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  30.88 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4680  hypothetical protein  29.36 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1407  hypothetical protein  30.22 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2748  CopG family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  28.24 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  29.55 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3342  hypothetical protein  31.11 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.589243  normal  0.0213598 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  29.77 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0032  hypothetical protein  28.44 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.475298  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  31.85 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4580  hypothetical protein  28.44 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0417201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4601  hypothetical protein  28.44 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0107991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  27.48 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4418  hypothetical protein  28.44 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200049  normal  0.0150185 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4409  hypothetical protein  28.44 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.901332 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  28.03 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4060  protein of unknown function UPF0150  30.15 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  30.16 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  29.2 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  25.9 
 
 		 138 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  29.86 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  26.87 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  24 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>