72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3439 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  276  7e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  276  7e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  276  7e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  41.01 
 
 		 137 aa  91.3  4e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2305  hypothetical protein  36.09 
 
 		 139 aa  89.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  37.69 
 
 		 134 aa  83.6  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  32.12 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  35.04 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  34.31 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  33.57 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  32.59 
 
 		 131 aa  67  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  34.38 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  31.88 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  37.9 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  35.4 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  31.71 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  28.36 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  32.56 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  31.65 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  32.2 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  30.51 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  27.94 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  33.08 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  27.74 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  27.87 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2748  CopG family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  28.36 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1407  hypothetical protein  35.59 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  29.01 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  29.57 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  30.37 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  25.56 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  37.29 
 
 		 68 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  35.59 
 
 		 72 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4214  hypothetical protein  35.59 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  30.83 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4418  hypothetical protein  29.91 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200049  normal  0.0150185 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4580  hypothetical protein  29.91 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0417201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4601  hypothetical protein  29.91 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0107991  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0032  hypothetical protein  29.91 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.475298  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4409  hypothetical protein  29.91 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.901332 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3342  hypothetical protein  35.29 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.589243  normal  0.0213598 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4060  protein of unknown function UPF0150  31.97 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  29.29 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  29.03 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  44.19 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  29.91 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  28.47 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  41.51 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  26.61 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  32.2 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  42.55 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0585  hypothetical protein  35.85 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290955  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2369  hypothetical protein  32.08 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00651332  normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  29.09 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  27.52 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  34.55 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0600  hypothetical protein  37.74 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  29.82 
 
 		 71 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0010  hypothetical protein  33.33 
 
 		 86 aa  42  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.324673  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  29.82 
 
 		 71 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  30.77 
 
 		 130 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2598  hypothetical protein  27.93 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0800472  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3129  protein of unknown function UPF0150  30.51 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.28092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4420  hypothetical protein  27.69 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0134  hypothetical protein  31.3 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501544  normal  0.0368693 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1797  hypothetical protein  30.91 
 
 		 74 aa  40.4  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  41.86 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>