120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2770 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  295  1e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  45.65 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  40.43 
 
 		 131 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  42.98 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  38.46 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  36.36 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  54.84 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3760  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  35.38 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  36.88 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  36.22 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  35.38 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  30.67 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  36.89 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  30.67 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  36.22 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  30.56 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0019  protein of unknown function UPF0150  46.27 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0272418  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  31.88 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  33.06 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  62  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  34.59 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  29.69 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  42.5 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  36.3 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4060  protein of unknown function UPF0150  30.56 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  47.27 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  31.2 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  33.61 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  48.15 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2748  CopG family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  45.76 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1407  hypothetical protein  33.08 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  31.54 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  34.13 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  28.12 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0134  hypothetical protein  31.43 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501544  normal  0.0368693 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  32.37 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  33.08 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  42.37 
 
 		 70 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  32.56 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3342  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.589243  normal  0.0213598 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  42.86 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  34.62 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  37.31 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3434  hypothetical protein  51.06 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141009  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2027  protein of unknown function UPF0150  41.54 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000026815  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0376  protein of unknown function UPF0150  41.79 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.586857  normal  0.0103099 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2253  hypothetical protein  44.12 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0842095  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1835  hypothetical protein  39.71 
 
 		 134 aa  52  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000086332  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  38.03 
 
 		 118 aa  52  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  33.86 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  38.75 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  41.38 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3513  hypothetical protein  48.94 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474161  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3792  hypothetical protein  48.94 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0190281  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  37.93 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  33.06 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2094  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000245077  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  30.71 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3432  hypothetical protein  46.81 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000618891  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1422  hypothetical protein  50 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.368149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  28.19 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2305  hypothetical protein  31.85 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1450  protein of unknown function UPF0150  45.65 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2369  hypothetical protein  37.5 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00651332  normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3983  hypothetical protein  42.37 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.959866  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  42.31 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0010  hypothetical protein  35 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.324673  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  38.89 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  40.3 
 
 		 99 aa  47.4  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0585  hypothetical protein  45.1 
 
 		 69 aa  47.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290955  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  39.22 
 
 		 75 aa  47  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  36.67 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0299  hypothetical protein  41.67 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.046828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  51.35 
 
 		 72 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4389  hypothetical protein  39.22 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.400266  normal  0.0706735 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  33.96 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  42.22 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2598  hypothetical protein  25 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0800472  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1837  hypothetical protein  38.46 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  26.61 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  26.61 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  26.61 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  38.98 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  38.98 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1096  hypothetical protein  48.78 
 
 		 48 aa  43.9  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.497626  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  45.24 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0600  hypothetical protein  45.45 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1857  hypothetical protein  36.11 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000000260993  unclonable  3.98436e-16 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  36.84 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4282  hypothetical protein  44.19 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.674146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  37.14 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3129  protein of unknown function UPF0150  38.89 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.28092 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>