101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1332 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  308  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  49.25 
 
 		 136 aa  138  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  49.25 
 
 		 136 aa  137  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  48.91 
 
 		 137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  44.03 
 
 		 134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  40.15 
 
 		 134 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  42.54 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  38.35 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  41.54 
 
 		 142 aa  103  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  41.79 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  40.46 
 
 		 136 aa  100  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 136 aa  99.4  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  40.77 
 
 		 137 aa  97.4  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  40.3 
 
 		 138 aa  97.4  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  37.5 
 
 		 145 aa  97.4  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2598  hypothetical protein  36.96 
 
 		 140 aa  94.4  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0800472  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  38.81 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  37.59 
 
 		 137 aa  86.7  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  34.38 
 
 		 132 aa  84  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  34.38 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  36.64 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  34.62 
 
 		 132 aa  80.1  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  38.71 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  36.92 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  43.02 
 
 		 99 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  36.13 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  34.62 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2305  hypothetical protein  34.56 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4680  hypothetical protein  33.81 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  67  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  67  0.00000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  67  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4418  hypothetical protein  31.91 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200049  normal  0.0150185 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4601  hypothetical protein  31.91 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0107991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0042  hypothetical protein  31.03 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.567863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4409  hypothetical protein  31.91 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.901332 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0032  hypothetical protein  31.21 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.475298  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  32 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  36.43 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4580  hypothetical protein  31.21 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0417201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  32.35 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  35.38 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  41.94 
 
 		 70 aa  57.8  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  32.37 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  32.38 
 
 		 130 aa  57  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  57.45 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  34.26 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  30.33 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  41.03 
 
 		 93 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3342  hypothetical protein  32.84 
 
 		 131 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.589243  normal  0.0213598 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  44.44 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  44.44 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  35.96 
 
 		 128 aa  52  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1721  CopG family DNA-binding protein  37.21 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337055  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  39.44 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  38.57 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  39.66 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  42.86 
 
 		 98 aa  50.4  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  34.33 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  41.82 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  41.82 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  31.01 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1551  hypothetical protein  31.19 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0376  protein of unknown function UPF0150  42.62 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.586857  normal  0.0103099 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  45 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4282  hypothetical protein  40 
 
 		 75 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.674146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2748  CopG family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  35.29 
 
 		 68 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  43.14 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1837  hypothetical protein  30.16 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1407  hypothetical protein  30.23 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4060  protein of unknown function UPF0150  29.77 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  34.33 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  35.59 
 
 		 71 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0585  hypothetical protein  36.67 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290955  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3101  hypothetical protein  45.1 
 
 		 56 aa  44.3  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.031062  normal  0.0887922 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0019  protein of unknown function UPF0150  32.91 
 
 		 93 aa  44.3  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0272418  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  28.57 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  38.18 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  38.18 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3513  hypothetical protein  36.51 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474161  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3792  hypothetical protein  36.51 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0190281  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  31.34 
 
 		 75 aa  43.5  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2253  hypothetical protein  31.01 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0842095  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3432  hypothetical protein  34.92 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000618891  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  33.96 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  36.51 
 
 		 71 aa  42.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3434  hypothetical protein  36.51 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141009  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1973  hypothetical protein  40.35 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.193383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  35.94 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  38.24 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  34.85 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  37.5 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  37.7 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  27.96 
 
 		 135 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1009  hypothetical protein  47.83 
 
 		 76 aa  41.2  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000893941  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  42.55 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  42.55 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2369  hypothetical protein  25 
 
 		 80 aa  40  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00651332  normal  0.158855 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>