54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_A0010 on replicon NC_008263
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008263  CPR_A0010  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.324673  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  45.68 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  44.44 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1450  protein of unknown function UPF0150  32.1 
 
 		 133 aa  63.5  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  40.24 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  37.33 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3432  hypothetical protein  36.25 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000618891  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  35.21 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  42 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3434  hypothetical protein  32.5 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141009  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  40 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  48.28 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  34.78 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  48.28 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  36 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0019  protein of unknown function UPF0150  32.35 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0272418  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3792  hypothetical protein  31.25 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0190281  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3513  hypothetical protein  31.25 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474161  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  33.87 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  47.37 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  35 
 
 		 145 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  38.78 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0600  hypothetical protein  37.7 
 
 		 70 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2369  hypothetical protein  35.19 
 
 		 80 aa  45.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00651332  normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  27.27 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  33.8 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0670  hypothetical protein  40.38 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.720771  normal  0.417071 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  33.87 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1294  hypothetical protein  29.89 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.289412  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  40 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  29.63 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1837  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  36.36 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  33.87 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0802  hypothetical protein  29.49 
 
 		 80 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.376551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  28.57 
 
 		 138 aa  41.6  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  39.66 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  31.48 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2298  transcriptional regulator, XRE family  30.16 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0522816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  37.88 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  52.78 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  26.87 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  29.63 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4876  hypothetical protein  25.33 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  32.08 
 
 		 145 aa  40.4  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2253  hypothetical protein  31.65 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0842095  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  32.79 
 
 		 78 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  27.78 
 
 		 134 aa  40  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>