156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2885 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  281  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  52.24 
 
 		 134 aa  158  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 134 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  43.51 
 
 		 145 aa  123  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  44.27 
 
 		 138 aa  121  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  47.01 
 
 		 136 aa  118  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  46.09 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  46.27 
 
 		 136 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  40 
 
 		 133 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  43.41 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  45.97 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  42.54 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  42.64 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  41.48 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  42.06 
 
 		 136 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 136 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  42.74 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  41.91 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  37.69 
 
 		 135 aa  100  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  43.7 
 
 		 130 aa  99.4  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  42.06 
 
 		 132 aa  97.8  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  34.11 
 
 		 134 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  36.36 
 
 		 134 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  36.09 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  35.66 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2598  hypothetical protein  35.56 
 
 		 140 aa  92  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0800472  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  40.65 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  40.8 
 
 		 130 aa  83.6  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2305  hypothetical protein  34.65 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1721  CopG family DNA-binding protein  48.28 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337055  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  35.11 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  36.36 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  35.04 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  35.04 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  35.04 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  48.24 
 
 		 99 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  34.21 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  32.26 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3342  hypothetical protein  32.54 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.589243  normal  0.0213598 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  44.93 
 
 		 98 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  31.82 
 
 		 139 aa  72  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2748  CopG family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1407  hypothetical protein  30.58 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4060  protein of unknown function UPF0150  32.33 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  32.06 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4282  hypothetical protein  59.26 
 
 		 75 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.674146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  52.46 
 
 		 71 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  30.58 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  55.93 
 
 		 70 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  28.57 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  31.2 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  39.76 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5266  hypothetical protein  28.23 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5593  hypothetical protein  28.23 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  38.27 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  46.67 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  49.18 
 
 		 69 aa  57.4  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4214  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3280  hypothetical protein  50 
 
 		 97 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3129  protein of unknown function UPF0150  46.67 
 
 		 68 aa  57  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.28092 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0376  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 		 78 aa  56.6  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.586857  normal  0.0103099 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  30.84 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  45.16 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3887  hypothetical protein  28.8 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  28.68 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  51.85 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  42.37 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  43.33 
 
 		 72 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0042  hypothetical protein  30.53 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.567863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0585  hypothetical protein  41.38 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290955  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1712  hypothetical protein  29.13 
 
 		 171 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2369  hypothetical protein  41.38 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00651332  normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  28.99 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  46.43 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  42.11 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  42.11 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4680  hypothetical protein  31.75 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1797  hypothetical protein  44.83 
 
 		 74 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  43.86 
 
 		 72 aa  52  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0134  hypothetical protein  28.68 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501544  normal  0.0368693 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  36.67 
 
 		 130 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4420  hypothetical protein  26.61 
 
 		 140 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0299  hypothetical protein  48 
 
 		 113 aa  50.1  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.046828  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2253  hypothetical protein  32.82 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0842095  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  40.68 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1837  hypothetical protein  29.5 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1450  protein of unknown function UPF0150  27.48 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0010  hypothetical protein  33.87 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.324673  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  30.69 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  44.62 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1096  hypothetical protein  45.45 
 
 		 48 aa  47.4  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.497626  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 		 78 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  37.88 
 
 		 74 aa  47.4  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4409  hypothetical protein  25.55 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.901332 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4418  hypothetical protein  25.55 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200049  normal  0.0150185 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4601  hypothetical protein  25.55 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0107991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2300  hypothetical protein  36 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>