56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4060 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4060  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 		 131 aa  261  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  55.38 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3342  hypothetical protein  51.56 
 
 		 131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.589243  normal  0.0213598 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  50 
 
 		 134 aa  127  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2748  CopG family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 131 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1407  hypothetical protein  45.31 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  41.61 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  40.46 
 
 		 132 aa  87.4  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  37.98 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  40.8 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  34.11 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  33.58 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  32.33 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  31.5 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  33.08 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  35.16 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  30.56 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  31.54 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  31.3 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  29.2 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  28.91 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  32.06 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  32.35 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  27.61 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  31.69 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  27.21 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3280  hypothetical protein  46 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  39.06 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  31.94 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  30.37 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  30.88 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  31.82 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  42.37 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  26.87 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  30.66 
 
 		 137 aa  48.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  31.97 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  31.97 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  31.97 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  34.31 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  29.77 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2305  hypothetical protein  30.15 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3760  hypothetical protein  24 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4022  protein of unknown function UPF0150  45.16 
 
 		 94 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2022  hypothetical protein  40.74 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125312 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  26.92 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  29.85 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  44 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  29.63 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1835  hypothetical protein  28.37 
 
 		 134 aa  42.7  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000086332  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0384  hypothetical protein  50 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.758655  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3369  hypothetical protein  41.94 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  31.25 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0134  hypothetical protein  25.6 
 
 		 132 aa  40  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501544  normal  0.0368693 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>