32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4022 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4022  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 		 94 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2022  hypothetical protein  76.29 
 
 		 97 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125312 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3369  hypothetical protein  84.71 
 
 		 155 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3280  hypothetical protein  52.58 
 
 		 97 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  46.51 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  45.05 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  45.83 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  52.78 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  46.38 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  59.18 
 
 		 132 aa  62  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  46.88 
 
 		 93 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  39.36 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3281  hypothetical protein  47.19 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  40.85 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  42.62 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  50 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4060  protein of unknown function UPF0150  34.33 
 
 		 131 aa  47.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  35.44 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  35.29 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1857  hypothetical protein  48.98 
 
 		 138 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000000260993  unclonable  3.98436e-16 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3342  hypothetical protein  36 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.589243  normal  0.0213598 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  54.29 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  34 
 
 		 134 aa  43.5  0.0009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  35.29 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  27.47 
 
 		 138 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1721  CopG family DNA-binding protein  36.11 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337055  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  42.86 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1059  hypothetical protein  36.59 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  35.06 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  41.27 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>