120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2018 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  256  7e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  52.8 
 
 		 132 aa  123  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  48.41 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 134 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  48.72 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  40.65 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  44.25 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3342  hypothetical protein  36.84 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.589243  normal  0.0213598 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2748  CopG family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1407  hypothetical protein  36.92 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  37.1 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  39.37 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  37.4 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  35.77 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  40.8 
 
 		 130 aa  73.6  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  37.01 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  40.31 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  34.62 
 
 		 150 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  38.14 
 
 		 138 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  33.88 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  33.82 
 
 		 134 aa  67  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  33.61 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  34.62 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  35.51 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  33.6 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  33.86 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  46.38 
 
 		 98 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  32.99 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  34.59 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  38.94 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  35.96 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  36.36 
 
 		 137 aa  62  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  35.71 
 
 		 131 aa  62  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  35.4 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  35.4 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  35.4 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4060  protein of unknown function UPF0150  31.3 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  41.57 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0134  hypothetical protein  35.38 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501544  normal  0.0368693 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2448  CopG domain protein DNA-binding domain protein  36.36 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  45.45 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  33.75 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0019  protein of unknown function UPF0150  37.35 
 
 		 93 aa  57  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0272418  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  35.92 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  40.62 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  32.23 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0376  protein of unknown function UPF0150  48.21 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.586857  normal  0.0103099 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2598  hypothetical protein  26.81 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0800472  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  38 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  43.64 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0010  hypothetical protein  47.73 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.324673  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  55.1 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  40.35 
 
 		 75 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  41.1 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  38.57 
 
 		 71 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0585  hypothetical protein  45.45 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290955  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  38.57 
 
 		 71 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1797  hypothetical protein  41.33 
 
 		 74 aa  50.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  41.38 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3280  hypothetical protein  45.45 
 
 		 97 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  39.39 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3760  hypothetical protein  32.09 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  29.41 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0042  hypothetical protein  30.3 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.567863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  46.81 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  30.65 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  46.81 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  42.37 
 
 		 130 aa  47.4  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  40.68 
 
 		 68 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0384  hypothetical protein  30.91 
 
 		 115 aa  47.8  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.758655  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4214  hypothetical protein  42.37 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  28.93 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4282  hypothetical protein  43.75 
 
 		 75 aa  47  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.674146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1551  hypothetical protein  29.46 
 
 		 129 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  37.93 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1837  hypothetical protein  33.01 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  35.29 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  35.29 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  28.85 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2305  hypothetical protein  29.2 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  38.98 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3129  protein of unknown function UPF0150  34.85 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.28092 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  33.05 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1096  hypothetical protein  48.78 
 
 		 48 aa  44.7  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.497626  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  36.92 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 		 78 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  36.92 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  34.62 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4680  hypothetical protein  28.57 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0990  hypothetical protein  32.81 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000238527  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1721  CopG family DNA-binding protein  44.9 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337055  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  38 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0947  hypothetical protein  27.56 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4022  protein of unknown function UPF0150  56.67 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1450  protein of unknown function UPF0150  32.18 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2208  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2221  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2043  hypothetical protein  41.82 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00057688  hitchhiker  0.0000000000000165138 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>