49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0990 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0990  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  239  1e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000238527  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  59.65 
 
 		 147 aa  144  5e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  48.15 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  41.44 
 
 		 130 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0158  protein of unknown function UPF0150  45.54 
 
 		 121 aa  94.7  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  45.54 
 
 		 121 aa  94.7  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  39.45 
 
 		 122 aa  88.6  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0789  hypothetical protein  40.71 
 
 		 160 aa  87.8  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0481  hypothetical protein  43.81 
 
 		 113 aa  86.7  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000325611  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0572  hypothetical protein  40.54 
 
 		 187 aa  84.7  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000321015  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  39.42 
 
 		 118 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  35.78 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  34.58 
 
 		 135 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  34.58 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  35.14 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  35.48 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4206  HicB family protein  32.29 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  45.1 
 
 		 71 aa  48.1  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1945  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 		 70 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1957  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516123 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0443  HicB family protein  31.18 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.134011  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0163  HicB family protein  32.29 
 
 		 107 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110553 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  41.18 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  41.18 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  23.53 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  32.81 
 
 		 129 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4167  HicB family protein  26.73 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  35.19 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  47.62 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2639  protein of unknown function UPF0150  35.71 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0218  hypothetical protein  35 
 
 		 72 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2591  HicB  32.04 
 
 		 112 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3668  HicB family protein  29.52 
 
 		 113 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0468154  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3322  hypothetical protein  33.33 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742622  normal  0.222376 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  27.37 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  39.58 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  32.79 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0019  protein of unknown function UPF0150  38.46 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0272418  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1593  protein of unknown function UPF0150  35.59 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  32.76 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1973  hypothetical protein  35.59 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.193383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  29.69 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0609  hypothetical protein  33.33 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000794304  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1551  hypothetical protein  31.58 
 
 		 129 aa  40.4  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0168  hypothetical protein  35 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333763  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4225  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 212 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0003  HicB  40.91 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1837  hypothetical protein  27.1 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>