65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2639 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2639  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 		 70 aa  147  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1945  protein of unknown function UPF0150  62.86 
 
 		 70 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1957  protein of unknown function UPF0150  62.86 
 
 		 70 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516123 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0609  hypothetical protein  58.57 
 
 		 74 aa  99.4  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000794304  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1953  protein of unknown function UPF0150  61.19 
 
 		 69 aa  95.9  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3322  hypothetical protein  55.71 
 
 		 70 aa  89.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742622  normal  0.222376 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1973  hypothetical protein  54.93 
 
 		 71 aa  88.6  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.193383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  54.93 
 
 		 71 aa  84.3  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1593  protein of unknown function UPF0150  55.22 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0168  hypothetical protein  50 
 
 		 72 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333763  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2300  hypothetical protein  46.03 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  42.62 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  35.48 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  46 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  43.64 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  39.34 
 
 		 78 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3215  protein of unknown function UPF0150  38.81 
 
 		 75 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304622 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  44.9 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  35.48 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0158  protein of unknown function UPF0150  44 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  46 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  45.16 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0271  hypothetical protein  33.33 
 
 		 73 aa  52  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  29.31 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0797  protein of unknown function UPF0150  39.66 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  33.87 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0249  hypothetical protein  35.94 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0740061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  33.87 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  35.09 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  42 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  38.33 
 
 		 68 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  38.33 
 
 		 68 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0218  hypothetical protein  33.33 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  38.6 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0866  protein of unknown function UPF0150  36.07 
 
 		 71 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4161  protein of unknown function UPF0150  35.48 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.49192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0838  protein of unknown function UPF0150  36.07 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4121  protein of unknown function UPF0150  35.48 
 
 		 69 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  42.86 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  35.09 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  33.9 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0789  hypothetical protein  43.75 
 
 		 160 aa  43.5  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1540  protein of unknown function UPF0150  31.94 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.0277095 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  42.86 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1837  hypothetical protein  37.5 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1513  protein of unknown function UPF0150  31.94 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0443  HicB family protein  30.16 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.134011  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  34.38 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0376  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.586857  normal  0.0103099 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0990  hypothetical protein  35.71 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000238527  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0572  hypothetical protein  40 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000321015  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0547  hypothetical protein  37.04 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000844189  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  33.33 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  40.43 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1009  hypothetical protein  38 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000893941  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2115  protein of unknown function UPF0150  42.22 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  32.76 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2648  hypothetical protein  42.55 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  31.03 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  39.53 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0717  hypothetical protein  38.3 
 
 		 57 aa  40.8  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.810179  normal  0.0354366 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  36.36 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0167  hypothetical protein  43.24 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>