46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0168 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0168  hypothetical protein  100 
 
 		 72 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333763  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  68.12 
 
 		 71 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1593  protein of unknown function UPF0150  64.29 
 
 		 70 aa  105  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1973  hypothetical protein  61.76 
 
 		 71 aa  99  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.193383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1945  protein of unknown function UPF0150  57.35 
 
 		 70 aa  84.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1957  protein of unknown function UPF0150  55.88 
 
 		 70 aa  82.8  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516123 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1953  protein of unknown function UPF0150  54.29 
 
 		 69 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0609  hypothetical protein  56.72 
 
 		 74 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000794304  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2639  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 		 70 aa  75.9  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3322  hypothetical protein  49.21 
 
 		 70 aa  70.5  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742622  normal  0.222376 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0271  hypothetical protein  42.65 
 
 		 73 aa  62  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  36.51 
 
 		 69 aa  54.7  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0218  hypothetical protein  33.33 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  40.68 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  39.39 
 
 		 78 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0866  protein of unknown function UPF0150  34.78 
 
 		 71 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0838  protein of unknown function UPF0150  34.78 
 
 		 71 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  42 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2300  hypothetical protein  39.06 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  41.27 
 
 		 71 aa  47  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0158  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3129  protein of unknown function UPF0150  34.92 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.28092 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1540  protein of unknown function UPF0150  29.17 
 
 		 73 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.0277095 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1513  protein of unknown function UPF0150  29.17 
 
 		 73 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  31.94 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4316  protein of unknown function UPF0150  34.43 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  37.29 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  37.29 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4378  protein of unknown function UPF0150  34.43 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000452582  unclonable  0.00000000142401 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  35.09 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  35.09 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  38.98 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2178  hypothetical protein  33.33 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  31.15 
 
 		 131 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  37.25 
 
 		 122 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  37.5 
 
 		 67 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4121  protein of unknown function UPF0150  30 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0717  hypothetical protein  45 
 
 		 57 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.810179  normal  0.0354366 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0443  HicB family protein  27.59 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.134011  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0483  hypothetical protein  37.5 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.243945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4161  protein of unknown function UPF0150  30 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.49192 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0990  hypothetical protein  35 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000238527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  38.98 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2369  hypothetical protein  31.25 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00651332  normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0620  hypothetical protein  38.33 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2598  hypothetical protein  27.42 
 
 		 140 aa  40  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0800472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>