35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3668 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3668  HicB family protein  100 
 
 		 113 aa  232  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0468154  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0443  HicB family protein  55.86 
 
 		 118 aa  141  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.134011  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2750  HicB family protein  37.84 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2139  HicB family protein  35.58 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252397  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4206  HicB family protein  36.7 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4167  HicB family protein  35.78 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30660  Conserved hypothetical protein, HicB- family  31.07 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5179  HicB family protein  34.29 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0003  HicB  48.28 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0163  HicB family protein  33.67 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110553 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4182  hypothetical protein  31.73 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.270938 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0059  HicB family protein  33.65 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0572  hypothetical protein  48.94 
 
 		 187 aa  48.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000321015  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1479  hicB protein  31.73 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4242  HicB family protein  31.73 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0481  hypothetical protein  36.23 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000325611  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1361  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00209269  hitchhiker  6.37946e-19 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0020  HicB family protein  28.7 
 
 		 105 aa  47  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000476189  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4138  HicB family protein  30.77 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2191  HicB family protein  29.91 
 
 		 105 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0789  hypothetical protein  38.1 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3197  HicB  29.81 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2749  hypothetical protein  27.78 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.254475  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0431  HicB family protein  29.09 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  47.62 
 
 		 147 aa  42.7  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3215  protein of unknown function UPF0150  36.21 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304622 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  31.25 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2214  hypothetical protein  41.86 
 
 		 111 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.44571  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0990  hypothetical protein  29.52 
 
 		 116 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000238527  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1368  HicB family protein  39.53 
 
 		 112 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1110  HicB-related protein  23.64 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0280  HicB family protein  28.7 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.073142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2425  HicB family protein  36.71 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  28.81 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4161  protein of unknown function UPF0150  36.21 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.49192 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>