49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1837 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1837  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  275  2e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  46.97 
 
 		 139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  40.74 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1551  hypothetical protein  35.66 
 
 		 129 aa  92  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  37.01 
 
 		 138 aa  84.3  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1450  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3513  hypothetical protein  33.83 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474161  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3792  hypothetical protein  33.83 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0190281  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3434  hypothetical protein  31.06 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141009  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1835  hypothetical protein  35.11 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000086332  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3432  hypothetical protein  31.34 
 
 		 140 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000618891  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2253  hypothetical protein  31.34 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0842095  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  33.08 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3797  hypothetical protein  28.8 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  27.05 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2027  protein of unknown function UPF0150  30 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000026815  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  29.1 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  32.52 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  31.4 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  42.37 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  38.57 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  32.73 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  29.5 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2094  protein of unknown function UPF0150  26.98 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000245077  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  32.35 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  42.31 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  30.16 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  30.69 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  28.71 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  33.01 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  35.94 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0019  protein of unknown function UPF0150  32.39 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0272418  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0789  hypothetical protein  26.77 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  38.46 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0010  hypothetical protein  33.33 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.324673  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  25.71 
 
 		 131 aa  43.9  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  28.83 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2639  protein of unknown function UPF0150  37.5 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  32.84 
 
 		 130 aa  42.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  31.48 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  35.21 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  23.53 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  33.87 
 
 		 130 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  34.92 
 
 		 118 aa  41.2  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2298  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0522816 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  28.85 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0990  hypothetical protein  27.1 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000238527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>