35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4167 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_4167  HicB family protein  100 
 
 
108 aa  223  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4206  HicB family protein  98.15 
 
 
108 aa  218  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2139  HicB family protein  65.38 
 
 
113 aa  147  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252397  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0163  HicB family protein  64.49 
 
 
107 aa  147  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.110553 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2750  HicB family protein  66.02 
 
 
109 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0158  protein of unknown function UPF0150  36.7 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  34.86 
 
 
121 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0443  HicB family protein  32.35 
 
 
118 aa  62  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.134011  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3668  HicB family protein  35.78 
 
 
113 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0468154  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0003  HicB  33.02 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0481  hypothetical protein  35 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000325611  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  37.5 
 
 
122 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0572  hypothetical protein  39 
 
 
187 aa  53.9  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000321015  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0789  hypothetical protein  32.08 
 
 
160 aa  53.5  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2214  hypothetical protein  55.56 
 
 
111 aa  51.6  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.44571  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  47.06 
 
 
121 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2191  HicB family protein  32.11 
 
 
105 aa  50.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0280  HicB family protein  28.57 
 
 
122 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.073142  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  36.17 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0435  HicB family protein  56.41 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.783956  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0059  HicB family protein  28.3 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4182  hypothetical protein  29.25 
 
 
110 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.270938 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5179  HicB family protein  31.07 
 
 
118 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2591  HicB  35.62 
 
 
112 aa  44.3  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887036  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0990  hypothetical protein  26.73 
 
 
116 aa  43.9  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000238527  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  40.82 
 
 
130 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30660  Conserved hypothetical protein, HicB- family  29.73 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0431  HicB family protein  28.85 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  30.61 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0020  HicB family protein  27.52 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000476189  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1110  HicB-related protein  48.72 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2749  hypothetical protein  27.35 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.254475  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2250  HicB family protein  43.59 
 
 
110 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2260  HicB family protein  43.59 
 
 
110 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  29.91 
 
 
135 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>