99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2242 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  142  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0218  hypothetical protein  51.61 
 
 
72 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0838  protein of unknown function UPF0150  53.33 
 
 
71 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0866  protein of unknown function UPF0150  51.67 
 
 
71 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1953  protein of unknown function UPF0150  43.94 
 
 
69 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  46.38 
 
 
72 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  42.86 
 
 
71 aa  64.3  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3322  hypothetical protein  40.62 
 
 
70 aa  61.6  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742622  normal  0.222376 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  56.6 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0609  hypothetical protein  38.46 
 
 
74 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000794304  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1593  protein of unknown function UPF0150  38.24 
 
 
70 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0271  hypothetical protein  46.03 
 
 
73 aa  58.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2639  protein of unknown function UPF0150  42.62 
 
 
70 aa  58.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  48.08 
 
 
118 aa  56.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  35.82 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  37.7 
 
 
130 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1973  hypothetical protein  34.92 
 
 
71 aa  54.7  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.193383  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0168  hypothetical protein  36.51 
 
 
72 aa  54.7  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333763  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1945  protein of unknown function UPF0150  34.33 
 
 
70 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1957  protein of unknown function UPF0150  34.33 
 
 
70 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.516123 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 
135 aa  53.9  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  45.1 
 
 
121 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  40.32 
 
 
137 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0158  protein of unknown function UPF0150  40.35 
 
 
121 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  47.17 
 
 
78 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0572  hypothetical protein  38.98 
 
 
187 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000321015  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3129  protein of unknown function UPF0150  38.24 
 
 
68 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.28092 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  47.06 
 
 
121 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1797  hypothetical protein  38.24 
 
 
74 aa  51.6  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  41.27 
 
 
71 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  34.43 
 
 
75 aa  50.8  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  37.5 
 
 
65 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  35.48 
 
 
71 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  35.48 
 
 
71 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  38.1 
 
 
130 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  42.59 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  39.34 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  38.1 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  36.67 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  36.51 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  34.48 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  45.76 
 
 
70 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  41.51 
 
 
122 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  38.89 
 
 
75 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  36.67 
 
 
138 aa  47.8  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  34.33 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2115  hypothetical protein  33.8 
 
 
82 aa  47  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.592477  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  42.62 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2122  hypothetical protein  36.84 
 
 
72 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00580753  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2300  hypothetical protein  38.1 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  38.98 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1361  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00209269  hitchhiker  6.37946e-19 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 
72 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0600  hypothetical protein  31.34 
 
 
70 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 
72 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  41.94 
 
 
72 aa  45.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0585  hypothetical protein  33.33 
 
 
69 aa  44.7  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290955  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  31.75 
 
 
132 aa  45.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  38.89 
 
 
68 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  38.89 
 
 
68 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  38.24 
 
 
69 aa  44.7  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  36.73 
 
 
135 aa  44.3  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2553  hypothetical protein  38.64 
 
 
75 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0369521  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0249  hypothetical protein  32.81 
 
 
76 aa  44.3  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0740061  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0481  hypothetical protein  40.38 
 
 
113 aa  44.3  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000325611  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0210  protein of unknown function UPF0150  36.21 
 
 
68 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 
74 aa  43.9  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0206  protein of unknown function UPF0150  36.21 
 
 
68 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139417 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2598  hypothetical protein  36.67 
 
 
140 aa  43.9  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0800472  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  35.48 
 
 
131 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0019  protein of unknown function UPF0150  30 
 
 
93 aa  43.9  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0272418  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  36.23 
 
 
130 aa  43.5  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  32.35 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  39.58 
 
 
74 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  35.59 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  36.54 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  37.5 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  32.35 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0802  hypothetical protein  39.22 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.376551  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  37.5 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  33.33 
 
 
74 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  35.71 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  43.9 
 
 
96 aa  42  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  37.5 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  32.26 
 
 
130 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0797  protein of unknown function UPF0150  37.29 
 
 
74 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2369  hypothetical protein  31.34 
 
 
80 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00651332  normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  31.67 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0990  hypothetical protein  32.79 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000238527  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  33.96 
 
 
98 aa  41.2  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  42.86 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  35.82 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  43.4 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0376  protein of unknown function UPF0150  33.8 
 
 
78 aa  40.8  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.586857  normal  0.0103099 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  43.4 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  32.08 
 
 
72 aa  40.4  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  31.58 
 
 
98 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  48.72 
 
 
72 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2139  HicB family protein  30.3 
 
 
113 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>