30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2115 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_2115  hypothetical protein  100 
 
 
82 aa  172  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.592477  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  41.07 
 
 
72 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  41.07 
 
 
72 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0271  hypothetical protein  39.66 
 
 
73 aa  47.4  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  33.8 
 
 
69 aa  47  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 
68 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 
68 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  39.66 
 
 
71 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3215  protein of unknown function UPF0150  31.25 
 
 
75 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304622 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  43.1 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  38.03 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0299  hypothetical protein  41.27 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.046828  normal 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  38.6 
 
 
68 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 
142 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  38.6 
 
 
68 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  36.76 
 
 
137 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  44.07 
 
 
134 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  30.3 
 
 
138 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  34.78 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  35.59 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0443  protein of unknown function UPF0150  35.59 
 
 
76 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0276188 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  34.78 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  29.31 
 
 
71 aa  40.8  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  39.13 
 
 
74 aa  40.8  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  32.31 
 
 
137 aa  40.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2363  hypothetical protein  40 
 
 
72 aa  40.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.555585  normal  0.0574979 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  40 
 
 
72 aa  40.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  33.93 
 
 
78 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1513  protein of unknown function UPF0150  32.26 
 
 
73 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1540  protein of unknown function UPF0150  32.26 
 
 
73 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.0277095 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>