31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3215 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3215  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 		 75 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304622 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0249  hypothetical protein  63.24 
 
 		 76 aa  94.7  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0740061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4161  protein of unknown function UPF0150  68.25 
 
 		 69 aa  90.5  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.49192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4121  protein of unknown function UPF0150  68.25 
 
 		 69 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0651  protein of unknown function UPF0150  63.49 
 
 		 69 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2178  hypothetical protein  48.39 
 
 		 72 aa  70.1  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3122  hypothetical protein  50 
 
 		 73 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000326959  normal  0.802699 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1513  protein of unknown function UPF0150  40.91 
 
 		 73 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1540  protein of unknown function UPF0150  40.91 
 
 		 73 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.0277095 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1361  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00209269  hitchhiker  6.37946e-19 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2639  protein of unknown function UPF0150  38.81 
 
 		 70 aa  52.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1945  protein of unknown function UPF0150  35.82 
 
 		 70 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1957  protein of unknown function UPF0150  35.82 
 
 		 70 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516123 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4627  hypothetical protein  39.66 
 
 		 71 aa  48.9  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.549044  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0609  hypothetical protein  36.51 
 
 		 74 aa  47.4  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000794304  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1593  protein of unknown function UPF0150  34.92 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3322  hypothetical protein  34.85 
 
 		 70 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742622  normal  0.222376 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  30 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1973  hypothetical protein  31.43 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.193383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1953  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2115  hypothetical protein  31.25 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.592477  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  53.49 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0443  HicB family protein  30.36 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.134011  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  34.38 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  30.43 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3668  HicB family protein  36.21 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0468154  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  31.25 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0379  protein of unknown function UPF0150  31.58 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.201735  hitchhiker  0.00342106 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  31.75 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 		 93 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>