26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1513 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1540  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 
73 aa  152  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.0277095 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1513  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 
73 aa  152  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4161  protein of unknown function UPF0150  47.62 
 
 
69 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.49192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0249  hypothetical protein  48.57 
 
 
76 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0740061  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3122  hypothetical protein  43.66 
 
 
73 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000326959  normal  0.802699 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4121  protein of unknown function UPF0150  46.03 
 
 
69 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1361  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 
147 aa  60.8  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00209269  hitchhiker  6.37946e-19 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3215  protein of unknown function UPF0150  40.91 
 
 
75 aa  60.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304622 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2178  hypothetical protein  41.43 
 
 
72 aa  57.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0651  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 
69 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1953  protein of unknown function UPF0150  34.33 
 
 
69 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0609  hypothetical protein  36.62 
 
 
74 aa  49.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000794304  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1945  protein of unknown function UPF0150  35.38 
 
 
70 aa  47.8  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1957  protein of unknown function UPF0150  35.38 
 
 
70 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.516123 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  35.71 
 
 
142 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1593  protein of unknown function UPF0150  29.17 
 
 
70 aa  45.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0168  hypothetical protein  29.17 
 
 
72 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333763  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  30.14 
 
 
71 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 
68 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 
68 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4316  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 
74 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4378  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 
74 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000452582  unclonable  0.00000000142401 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2639  protein of unknown function UPF0150  31.94 
 
 
70 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1973  hypothetical protein  26.03 
 
 
71 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.193383  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  28.99 
 
 
131 aa  40.4  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2115  hypothetical protein  32.26 
 
 
82 aa  40.4  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.592477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>