23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2178 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2178  hypothetical protein  100 
 
 
72 aa  154  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0651  protein of unknown function UPF0150  52.78 
 
 
69 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4627  hypothetical protein  63.46 
 
 
71 aa  73.9  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.549044  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0249  hypothetical protein  50.79 
 
 
76 aa  72.8  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0740061  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3215  protein of unknown function UPF0150  48.39 
 
 
75 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304622 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3122  hypothetical protein  47.89 
 
 
73 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000326959  normal  0.802699 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4121  protein of unknown function UPF0150  46.97 
 
 
69 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4161  protein of unknown function UPF0150  45.45 
 
 
69 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.49192 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1540  protein of unknown function UPF0150  41.43 
 
 
73 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.0277095 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1513  protein of unknown function UPF0150  41.43 
 
 
73 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1945  protein of unknown function UPF0150  39.68 
 
 
70 aa  50.4  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1957  protein of unknown function UPF0150  39.68 
 
 
70 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.516123 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1361  transcriptional regulator, XRE family  39.71 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00209269  hitchhiker  6.37946e-19 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1593  protein of unknown function UPF0150  35.48 
 
 
70 aa  43.5  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  33.87 
 
 
134 aa  42.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  33.33 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0168  hypothetical protein  33.33 
 
 
72 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333763  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  33.85 
 
 
71 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  43.4 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0609  hypothetical protein  34.43 
 
 
74 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000794304  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  29.69 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  39.06 
 
 
134 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>