29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4161 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4161  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 
69 aa  141  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.49192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4121  protein of unknown function UPF0150  98.55 
 
 
69 aa  139  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3215  protein of unknown function UPF0150  68.25 
 
 
75 aa  90.5  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304622 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0249  hypothetical protein  59.7 
 
 
76 aa  77  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0740061  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1540  protein of unknown function UPF0150  47.62 
 
 
73 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.0277095 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1513  protein of unknown function UPF0150  47.62 
 
 
73 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2178  hypothetical protein  45.45 
 
 
72 aa  63.5  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0651  protein of unknown function UPF0150  50.79 
 
 
69 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1361  transcriptional regulator, XRE family  53.33 
 
 
147 aa  60.1  0.000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00209269  hitchhiker  6.37946e-19 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1945  protein of unknown function UPF0150  42.19 
 
 
70 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1957  protein of unknown function UPF0150  42.19 
 
 
70 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.516123 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3122  hypothetical protein  48.39 
 
 
73 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000326959  normal  0.802699 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0609  hypothetical protein  38.33 
 
 
74 aa  51.6  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000794304  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3322  hypothetical protein  38.71 
 
 
70 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742622  normal  0.222376 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1953  protein of unknown function UPF0150  36.67 
 
 
69 aa  47  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  34.38 
 
 
71 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2639  protein of unknown function UPF0150  35.48 
 
 
70 aa  46.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1593  protein of unknown function UPF0150  35 
 
 
70 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  32.26 
 
 
131 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1973  hypothetical protein  28.12 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.193383  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  41.38 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  29.03 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  38.18 
 
 
75 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  30 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0168  hypothetical protein  30 
 
 
72 aa  40.8  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333763  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3668  HicB family protein  36.21 
 
 
113 aa  40.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0468154  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0866  protein of unknown function UPF0150  37.93 
 
 
71 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0376  protein of unknown function UPF0150  36.67 
 
 
78 aa  40  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.586857  normal  0.0103099 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2648  hypothetical protein  37.74 
 
 
82 aa  40  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>