69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0376 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0376  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 		 78 aa  156  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.586857  normal  0.0103099 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  65.33 
 
 		 75 aa  99.8  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0379  protein of unknown function UPF0150  57.69 
 
 		 80 aa  78.6  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.201735  hitchhiker  0.00342106 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1096  hypothetical protein  75.51 
 
 		 48 aa  78.6  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.497626  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  50.82 
 
 		 75 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  65.12 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  50 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  43.66 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  48.28 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  48.21 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  41.79 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  42.03 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  41.79 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  37.5 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  41.18 
 
 		 70 aa  51.6  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  42.86 
 
 		 79 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  42.86 
 
 		 79 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  42.62 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  55.81 
 
 		 136 aa  49.7  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0019  protein of unknown function UPF0150  45.83 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0272418  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  46.55 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  42.62 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  42.37 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  52.17 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  49.02 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  36.76 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  38.98 
 
 		 108 aa  47  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  47.92 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  47.92 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  38.33 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  45.28 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  36.62 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  34.72 
 
 		 72 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  40.68 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  35.48 
 
 		 71 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  37.14 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0620  hypothetical protein  39.29 
 
 		 72 aa  44.3  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  40.68 
 
 		 130 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  45.65 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1945  protein of unknown function UPF0150  35.82 
 
 		 70 aa  43.5  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2648  hypothetical protein  41.51 
 
 		 82 aa  42.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  28.99 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  43.4 
 
 		 71 aa  42.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  34.92 
 
 		 135 aa  42.7  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1957  protein of unknown function UPF0150  35.82 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516123 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  38.6 
 
 		 137 aa  42  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  33.96 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  32.86 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  40.43 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2363  hypothetical protein  33.96 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.555585  normal  0.0574979 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2639  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1234  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  37.5 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1973  hypothetical protein  33.87 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.193383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0595  protein of unknown function UPF0150  38.18 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.795214  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  33.82 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  37.93 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  33.8 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2369  hypothetical protein  32.86 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00651332  normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  34.43 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4389  hypothetical protein  30.77 
 
 		 81 aa  40  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.400266  normal  0.0706735 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  34.48 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  34.69 
 
 		 118 aa  40  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4161  protein of unknown function UPF0150  36.67 
 
 		 69 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.49192 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>