22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0249 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0249  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  158  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0740061  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3215  protein of unknown function UPF0150  63.24 
 
 
75 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304622 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0651  protein of unknown function UPF0150  62.3 
 
 
69 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3122  hypothetical protein  59.09 
 
 
73 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000326959  normal  0.802699 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4161  protein of unknown function UPF0150  59.7 
 
 
69 aa  77  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.49192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4121  protein of unknown function UPF0150  59.7 
 
 
69 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2178  hypothetical protein  50.79 
 
 
72 aa  72.8  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1540  protein of unknown function UPF0150  48.57 
 
 
73 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.0277095 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1513  protein of unknown function UPF0150  48.57 
 
 
73 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1361  transcriptional regulator, XRE family  46.58 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00209269  hitchhiker  6.37946e-19 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0609  hypothetical protein  44.26 
 
 
74 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000794304  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1945  protein of unknown function UPF0150  38.46 
 
 
70 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1957  protein of unknown function UPF0150  38.46 
 
 
70 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.516123 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1953  protein of unknown function UPF0150  34.92 
 
 
69 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2639  protein of unknown function UPF0150  35.94 
 
 
70 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3322  hypothetical protein  35.94 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742622  normal  0.222376 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4627  hypothetical protein  40.43 
 
 
71 aa  45.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.549044  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  32.81 
 
 
69 aa  44.3  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  32.31 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1973  hypothetical protein  29.23 
 
 
71 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.193383  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0443  HicB family protein  29.69 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.134011  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0271  hypothetical protein  32.31 
 
 
73 aa  40.4  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.183738 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>