90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1425 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 		 135 aa  276  9e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  81.48 
 
 		 135 aa  237  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  57.35 
 
 		 138 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  54.78 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  41.12 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0572  hypothetical protein  39.5 
 
 		 187 aa  92.4  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000321015  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  37.4 
 
 		 130 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  39.8 
 
 		 147 aa  87.4  6e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0158  protein of unknown function UPF0150  36.52 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  37.39 
 
 		 121 aa  86.7  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0990  hypothetical protein  35.78 
 
 		 116 aa  81.6  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000238527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  38.38 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  40.21 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0481  hypothetical protein  40.21 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000325611  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0789  hypothetical protein  36.28 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2300  hypothetical protein  49.28 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0463  hypothetical protein  47.44 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  60 
 
 		 65 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1945  protein of unknown function UPF0150  38.71 
 
 		 70 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1957  protein of unknown function UPF0150  38.71 
 
 		 70 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516123 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2639  protein of unknown function UPF0150  35.48 
 
 		 70 aa  57  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  27.59 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 		 71 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  40 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  28.12 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2098  hypothetical protein  43.66 
 
 		 77 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  32.11 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  39.66 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0609  hypothetical protein  33.87 
 
 		 74 aa  51.2  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000794304  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0595  protein of unknown function UPF0150  48.08 
 
 		 81 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.795214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3322  hypothetical protein  30.65 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742622  normal  0.222376 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0218  hypothetical protein  37.5 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1837  hypothetical protein  42.37 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1973  hypothetical protein  35.48 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.193383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0866  protein of unknown function UPF0150  33.87 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1953  protein of unknown function UPF0150  30.65 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0838  protein of unknown function UPF0150  33.87 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1593  protein of unknown function UPF0150  35.48 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  36 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  37.04 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  26.61 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  32.76 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4206  HicB family protein  31.78 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  30.28 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2363  hypothetical protein  37.7 
 
 		 72 aa  45.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.555585  normal  0.0574979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  33.9 
 
 		 75 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  37.7 
 
 		 72 aa  45.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0299  hypothetical protein  34.38 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.046828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  35.48 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  43.18 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  28.85 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0384  hypothetical protein  29.69 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.758655  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  35.42 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0784  protein of unknown function UPF0150  28.81 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.721186  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  28.07 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2178  hypothetical protein  41.67 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0010  hypothetical protein  33.87 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.324673  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  44.74 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  44.74 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  39.62 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  39.13 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  41.94 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  34.62 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  27.52 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  27.52 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  27.52 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  45.71 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1857  hypothetical protein  30.23 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000000260993  unclonable  3.98436e-16 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1835  hypothetical protein  32.69 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000086332  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  28.7 
 
 		 138 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0003  HicB  37.29 
 
 		 122 aa  41.6  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  29.23 
 
 		 98 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1435  hypothetical protein  41.3 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.374935  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 134 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  23.14 
 
 		 139 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  40.74 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2298  transcriptional regulator, XRE family  26.83 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0522816 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0947  hypothetical protein  27.85 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  30.51 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  30 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0206  protein of unknown function UPF0150  37.04 
 
 		 68 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139417 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0210  protein of unknown function UPF0150  37.04 
 
 		 68 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2250  HicB family protein  29.87 
 
 		 110 aa  40  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5716  hypothetical protein  34.55 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4167  HicB family protein  29.91 
 
 		 108 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0719  hypothetical protein  40 
 
 		 87 aa  40  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.08984  normal  0.0479916 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2260  HicB family protein  31.08 
 
 		 110 aa  40  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>