80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1998 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  60 
 
 		 145 aa  176  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  56.15 
 
 		 137 aa  159  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1721  CopG family DNA-binding protein  72.41 
 
 		 119 aa  134  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337055  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  49.64 
 
 		 136 aa  134  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  48.51 
 
 		 136 aa  125  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  44.27 
 
 		 137 aa  121  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  41.91 
 
 		 134 aa  106  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  44.62 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  41.54 
 
 		 137 aa  103  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 134 aa  103  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  38.52 
 
 		 137 aa  100  7e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  40.15 
 
 		 131 aa  97.8  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  40.3 
 
 		 150 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  37.5 
 
 		 132 aa  94.4  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  41.41 
 
 		 133 aa  94  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 136 aa  87.8  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  37.8 
 
 		 136 aa  87.8  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  32.84 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  33.09 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  37.6 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  40.48 
 
 		 132 aa  77.4  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  31.88 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  32.33 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  34.06 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2598  hypothetical protein  31.43 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0800472  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  35.54 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  40 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  34.68 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2305  hypothetical protein  34.81 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  33.86 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0042  hypothetical protein  32.88 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.567863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  29.69 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  35.05 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  31.54 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3342  hypothetical protein  30.71 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.589243  normal  0.0213598 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  28.36 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  28.36 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  28.36 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2748  CopG family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  32.82 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1407  hypothetical protein  30.89 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  40.91 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4060  protein of unknown function UPF0150  31.82 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0376  protein of unknown function UPF0150  46.55 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.586857  normal  0.0103099 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  36.92 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  35 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4680  hypothetical protein  29.03 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5593  hypothetical protein  24.11 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5266  hypothetical protein  24.11 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  35.09 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2122  hypothetical protein  33.33 
 
 		 72 aa  43.5  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00580753  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4580  hypothetical protein  26.36 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0417201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  37.74 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3760  hypothetical protein  25.86 
 
 		 140 aa  42  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  28.33 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0384  hypothetical protein  30.65 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.758655  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3887  hypothetical protein  18.6 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 		 65 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  28.7 
 
 		 135 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2115  hypothetical protein  30.3 
 
 		 82 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.592477  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4601  hypothetical protein  25.58 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0107991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4409  hypothetical protein  25.58 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.901332 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4418  hypothetical protein  25.58 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200049  normal  0.0150185 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  29.82 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4420  hypothetical protein  26.98 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  24.55 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4022  protein of unknown function UPF0150  37.97 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0032  hypothetical protein  25.58 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.475298  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3280  hypothetical protein  45.95 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  42 
 
 		 72 aa  40.4  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  37.5 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  38 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  38 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  41.07 
 
 		 78 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  29.41 
 
 		 135 aa  40  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2298  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 		 138 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0522816 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>