25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5593 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_5266  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  310  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5593  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  310  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1712  hypothetical protein  76.67 
 
 		 171 aa  239  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3887  hypothetical protein  76.67 
 
 		 149 aa  237  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1685  hypothetical protein  69.44 
 
 		 108 aa  160  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4420  hypothetical protein  51.09 
 
 		 140 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6926  hypothetical protein  53.68 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  31.25 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  32.59 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  29.37 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  28.23 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  26.77 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0550  hypothetical protein  44.64 
 
 		 99 aa  52  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  32.59 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  30.83 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  27.42 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  24.11 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  24 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  25.6 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  24.24 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  26.12 
 
 		 132 aa  44.7  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  24 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  27.34 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  26.36 
 
 		 136 aa  41.6  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>