66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1157 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  277  3e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  67.19 
 
 		 132 aa  190  5e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  57.26 
 
 		 133 aa  166  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  39.84 
 
 		 135 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 134 aa  100  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  40.31 
 
 		 136 aa  99  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  39.26 
 
 		 134 aa  99  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  39.53 
 
 		 136 aa  98.2  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  42.06 
 
 		 137 aa  97.8  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  37.3 
 
 		 145 aa  96.7  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  38.69 
 
 		 137 aa  94.7  4e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  37.5 
 
 		 138 aa  94.4  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 136 aa  90.9  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  35.82 
 
 		 136 aa  90.5  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  36.8 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  37.4 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  37.5 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  35.94 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  40 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  36.29 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  35.71 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  34.62 
 
 		 150 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  33.86 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  36.92 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  33.82 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  34.23 
 
 		 130 aa  70.1  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2305  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  29.37 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2748  CopG family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3342  hypothetical protein  32.26 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.589243  normal  0.0213598 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  40 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  33.88 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1407  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  36.51 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  33.63 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5593  hypothetical protein  29.37 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5266  hypothetical protein  29.37 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0042  hypothetical protein  32.37 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.567863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  30.4 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  34.09 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  62  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3887  hypothetical protein  30.4 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  32.56 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  32.56 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  32.56 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  30.71 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4060  protein of unknown function UPF0150  28.91 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4420  hypothetical protein  29.84 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1712  hypothetical protein  28.8 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4680  hypothetical protein  28.17 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1835  hypothetical protein  27.82 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000086332  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0032  hypothetical protein  27.27 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.475298  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2598  hypothetical protein  26.47 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0800472  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4580  hypothetical protein  27.46 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0417201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4601  hypothetical protein  26.76 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0107991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4418  hypothetical protein  26.76 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200049  normal  0.0150185 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4409  hypothetical protein  26.76 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.901332 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  27.61 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  39.29 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  38.71 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1450  protein of unknown function UPF0150  29.35 
 
 		 133 aa  43.5  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1721  CopG family DNA-binding protein  31.46 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337055  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0550  hypothetical protein  34.92 
 
 		 99 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  36.73 
 
 		 67 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  36.73 
 
 		 67 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  42 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>