12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0550 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0550  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  202  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1712  hypothetical protein  46.27 
 
 
171 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615969  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3887  hypothetical protein  44.62 
 
 
149 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5266  hypothetical protein  44.64 
 
 
150 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5593  hypothetical protein  44.64 
 
 
150 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4420  hypothetical protein  48.08 
 
 
140 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  29.51 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  39.66 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1685  hypothetical protein  35.82 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  35.09 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  34.92 
 
 
132 aa  41.2  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  34 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>