148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5077 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  100 
 
 		 134 aa  275  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  51.56 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  50 
 
 		 134 aa  135  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  45.86 
 
 		 136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  44.36 
 
 		 136 aa  120  9e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  47.69 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  45.45 
 
 		 131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  42.86 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  40.31 
 
 		 145 aa  110  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2598  hypothetical protein  36.96 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0800472  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  37.69 
 
 		 142 aa  107  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  41.35 
 
 		 137 aa  105  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  40.74 
 
 		 136 aa  104  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  39.26 
 
 		 134 aa  104  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 136 aa  103  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  39.85 
 
 		 138 aa  103  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  45.24 
 
 		 132 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  40.16 
 
 		 132 aa  100  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  34.85 
 
 		 134 aa  100  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  38.17 
 
 		 131 aa  100  9e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  42.19 
 
 		 132 aa  98.6  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2305  hypothetical protein  42.42 
 
 		 139 aa  99  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  41.86 
 
 		 135 aa  99  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  44.44 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  40.15 
 
 		 137 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  42.98 
 
 		 130 aa  91.3  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  35.38 
 
 		 137 aa  90.1  9e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  36.57 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  36.57 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  36.57 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  37.5 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3342  hypothetical protein  36.84 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.589243  normal  0.0213598 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  33.09 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1721  CopG family DNA-binding protein  43.53 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337055  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2748  CopG family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  35.56 
 
 		 99 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  37.21 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1407  hypothetical protein  36.36 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4060  protein of unknown function UPF0150  34.78 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  34.59 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  34.06 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  43.28 
 
 		 98 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  36.22 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4680  hypothetical protein  33.06 
 
 		 144 aa  60.1  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  36.19 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  46.55 
 
 		 70 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0042  hypothetical protein  36.09 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.567863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  36.64 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  43.33 
 
 		 72 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0019  protein of unknown function UPF0150  37.18 
 
 		 93 aa  57  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0272418  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  42.62 
 
 		 71 aa  57  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  32.31 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 		 71 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 		 71 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  31.54 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  47.27 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0010  hypothetical protein  40.98 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.324673  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  41.67 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4409  hypothetical protein  29.37 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.901332 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  40.98 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4418  hypothetical protein  29.37 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200049  normal  0.0150185 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4601  hypothetical protein  29.37 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0107991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  40.3 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  42.11 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0032  hypothetical protein  29.37 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.475298  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  46.3 
 
 		 72 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4282  hypothetical protein  40.74 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.674146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4580  hypothetical protein  29.37 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0417201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  35.48 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  47.27 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2369  hypothetical protein  34.85 
 
 		 80 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00651332  normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  31.68 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  31.88 
 
 		 68 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4214  hypothetical protein  34.78 
 
 		 68 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  30.3 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0376  protein of unknown function UPF0150  37.1 
 
 		 78 aa  50.4  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.586857  normal  0.0103099 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0585  hypothetical protein  39.66 
 
 		 69 aa  50.1  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290955  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  31.25 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  39.34 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1797  hypothetical protein  40.68 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  43.14 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3129  protein of unknown function UPF0150  35 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.28092 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  37.5 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0719  hypothetical protein  45.28 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.08984  normal  0.0479916 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  38.36 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  29.25 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1423  protein of unknown function UPF0150  41.38 
 
 		 147 aa  48.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1733  hypothetical protein  41.38 
 
 		 147 aa  48.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  37.1 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  43.4 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  36.07 
 
 		 71 aa  47.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01406  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2043  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00057688  hitchhiker  0.0000000000000165138 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0670  hypothetical protein  41.51 
 
 		 78 aa  47  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.720771  normal  0.417071 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1522  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1617  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2221  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>