19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1712 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1712  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  354  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615969  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3887  hypothetical protein  85.33 
 
 
149 aa  256  8e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5266  hypothetical protein  76.67 
 
 
150 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5593  hypothetical protein  76.67 
 
 
150 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1685  hypothetical protein  65.42 
 
 
108 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4420  hypothetical protein  48.57 
 
 
140 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6926  hypothetical protein  74.36 
 
 
125 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  31.25 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0550  hypothetical protein  46.27 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  32.31 
 
 
135 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  28.8 
 
 
132 aa  55.5  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  29.13 
 
 
137 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  24.6 
 
 
133 aa  49.3  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  27.03 
 
 
134 aa  47.4  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  22.9 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  28.57 
 
 
142 aa  42  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  25.95 
 
 
145 aa  41.2  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  24.62 
 
 
132 aa  41.2  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  28.36 
 
 
134 aa  40.8  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>