21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3887 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3887  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  308  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1712  hypothetical protein  85.33 
 
 		 171 aa  256  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5266  hypothetical protein  76.67 
 
 		 150 aa  237  5e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5593  hypothetical protein  76.67 
 
 		 150 aa  237  5e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1685  hypothetical protein  66.04 
 
 		 108 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4420  hypothetical protein  48.55 
 
 		 140 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6926  hypothetical protein  80 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  31.25 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  30.4 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  33.61 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  28.8 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0550  hypothetical protein  44.62 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  26.15 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  27.93 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  22.63 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  25.76 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  26.72 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  29.1 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  25 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  18.6 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>