122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0135 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  100 
 
 		 136 aa  276  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  94.12 
 
 		 136 aa  264  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  53.08 
 
 		 137 aa  132  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  43.75 
 
 		 136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  39.26 
 
 		 136 aa  110  9e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  43.85 
 
 		 132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  42.06 
 
 		 137 aa  107  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 134 aa  103  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  40.94 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  39.69 
 
 		 150 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  38.06 
 
 		 134 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  39.37 
 
 		 134 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  43.65 
 
 		 142 aa  98.6  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  39.26 
 
 		 145 aa  92  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  36 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  39.84 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  36.72 
 
 		 132 aa  90.9  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  39.84 
 
 		 133 aa  89  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  42.11 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  38.58 
 
 		 138 aa  87.8  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  42.86 
 
 		 137 aa  87  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  40.46 
 
 		 135 aa  85.5  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  38.76 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  41.98 
 
 		 99 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2748  CopG family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  39.5 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1407  hypothetical protein  37.86 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  38.81 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  39.32 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  37.69 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  35.88 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  34.85 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3342  hypothetical protein  37.98 
 
 		 131 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.589243  normal  0.0213598 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4060  protein of unknown function UPF0150  33.82 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2305  hypothetical protein  37.78 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2598  hypothetical protein  31.71 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0800472  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  32.82 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  34.35 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  30.77 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  35.56 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  48.39 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1721  CopG family DNA-binding protein  43.21 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337055  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4680  hypothetical protein  33.57 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0042  hypothetical protein  30.41 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.567863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  42.11 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  39.76 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4418  hypothetical protein  33.57 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200049  normal  0.0150185 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4601  hypothetical protein  33.57 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0107991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4409  hypothetical protein  33.57 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.901332 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2369  hypothetical protein  43.08 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00651332  normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  41.79 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  30.71 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0032  hypothetical protein  32.87 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.475298  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  59.57 
 
 		 72 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  40.62 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4580  hypothetical protein  32.87 
 
 		 151 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0417201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  41.27 
 
 		 70 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4214  hypothetical protein  42.19 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  40.62 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  46.94 
 
 		 75 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  43.86 
 
 		 74 aa  51.6  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4282  hypothetical protein  42.86 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.674146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  39.34 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  39.34 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  41.79 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0600  hypothetical protein  43.75 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  42.42 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  39.44 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3760  hypothetical protein  31.34 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  28.47 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0585  hypothetical protein  40.98 
 
 		 69 aa  47.8  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290955  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  38.98 
 
 		 72 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0134  hypothetical protein  28.99 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501544  normal  0.0368693 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4389  hypothetical protein  40.82 
 
 		 81 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.400266  normal  0.0706735 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  37.25 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  47.92 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1945  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1957  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516123 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  27.45 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0802  hypothetical protein  36.51 
 
 		 80 aa  45.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.376551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0299  hypothetical protein  46.3 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.046828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  30.08 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0443  protein of unknown function UPF0150  52.5 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0276188 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1797  hypothetical protein  41.07 
 
 		 74 aa  45.1  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  39.29 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  36.51 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  40.32 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  29.41 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  41.82 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  37.04 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  39.06 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  61.29 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  41.82 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  38.6 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5593  hypothetical protein  27.34 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>