34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4680 on replicon NC_010000
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010000  Sbal195_4680  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  296  5e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4409  hypothetical protein  81.94 
 
 		 151 aa  254  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.901332 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4601  hypothetical protein  81.94 
 
 		 151 aa  254  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0107991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4418  hypothetical protein  81.94 
 
 		 151 aa  254  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200049  normal  0.0150185 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4580  hypothetical protein  81.94 
 
 		 151 aa  254  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0417201  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0032  hypothetical protein  80.56 
 
 		 151 aa  249  8.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.475298  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0042  hypothetical protein  40.58 
 
 		 145 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.567863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  38.73 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  36.3 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  34.33 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  35.97 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  33.81 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  33.59 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  35.56 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  35.29 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 134 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  34.4 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  34.27 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  34.71 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2305  hypothetical protein  29.36 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  32.06 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  28.17 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  30.4 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  29.71 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  31.75 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  29.63 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  34.21 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  29.03 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  28.57 
 
 		 129 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  30.28 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2598  hypothetical protein  35.29 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0800472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>