131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3827 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  266  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  69.53 
 
 		 132 aa  186  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  75.63 
 
 		 130 aa  176  8e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  48.41 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  45.97 
 
 		 137 aa  111  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  45.52 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  41.98 
 
 		 138 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  38.46 
 
 		 134 aa  93.6  8e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4060  protein of unknown function UPF0150  41.61 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  40.43 
 
 		 145 aa  90.9  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  38.81 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  42.19 
 
 		 142 aa  87  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  40.31 
 
 		 131 aa  87  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  36.72 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  37.5 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  38.4 
 
 		 135 aa  83.6  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  38.52 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  38.84 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  52.17 
 
 		 98 aa  80.1  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2598  hypothetical protein  36.57 
 
 		 140 aa  80.1  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0800472  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  40.83 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  35.94 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  37.6 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  38.52 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  34.92 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3342  hypothetical protein  34.59 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.589243  normal  0.0213598 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  38.06 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  37.5 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  36.64 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  36.57 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2748  CopG family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  31.06 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  35.88 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3280  hypothetical protein  52.78 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  49.32 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  35.04 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  32.84 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  38.39 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1407  hypothetical protein  34.13 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  36.8 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  46.15 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2022  hypothetical protein  44.83 
 
 		 97 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125312 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  38.04 
 
 		 99 aa  62  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  31.97 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  53.85 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4022  protein of unknown function UPF0150  46.51 
 
 		 94 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  33.07 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  31.2 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3760  hypothetical protein  31.45 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0134  hypothetical protein  32.23 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501544  normal  0.0368693 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  30.51 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  30.51 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  30.51 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  41.38 
 
 		 71 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  41.38 
 
 		 71 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  45 
 
 		 75 aa  57  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2305  hypothetical protein  32.59 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0585  hypothetical protein  38.1 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290955  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0019  protein of unknown function UPF0150  47.46 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0272418  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1837  hypothetical protein  32.52 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  37.5 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  42.19 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1857  hypothetical protein  45.45 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000000260993  unclonable  3.98436e-16 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  29.91 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  36.07 
 
 		 72 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4282  hypothetical protein  40 
 
 		 75 aa  52.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.674146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1797  hypothetical protein  38.71 
 
 		 74 aa  53.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0376  protein of unknown function UPF0150  42.03 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.586857  normal  0.0103099 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  39.39 
 
 		 75 aa  53.5  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3369  hypothetical protein  63.64 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0010  hypothetical protein  40 
 
 		 86 aa  51.6  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.324673  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2448  CopG domain protein DNA-binding domain protein  30.16 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  29.41 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  36.21 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  43.64 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0802  hypothetical protein  34.78 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.376551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2369  hypothetical protein  33.82 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00651332  normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  44.64 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4680  hypothetical protein  34.21 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0600  hypothetical protein  35.29 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  29.01 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1835  hypothetical protein  30.19 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000086332  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2034  hypothetical protein  30.08 
 
 		 122 aa  47  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000850419  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2253  hypothetical protein  32.06 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0842095  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1721  CopG family DNA-binding protein  38.46 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337055  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  43.75 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0811  hypothetical protein  39.71 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00560796  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3101  hypothetical protein  52.63 
 
 		 56 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.031062  normal  0.0887922 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4580  hypothetical protein  30.65 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0417201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  29.69 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1294  hypothetical protein  38.03 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.289412  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4418  hypothetical protein  29.84 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200049  normal  0.0150185 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0670  hypothetical protein  44.68 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.720771  normal  0.417071 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4601  hypothetical protein  29.84 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0107991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4409  hypothetical protein  29.84 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.901332 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  56.41 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  35.48 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>