28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2253 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2253  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  290  6e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0842095  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  40.48 
 
 
138 aa  107  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3434  hypothetical protein  35.66 
 
 
137 aa  98.6  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141009  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3513  hypothetical protein  34.88 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474161  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3792  hypothetical protein  34.88 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0190281  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3432  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000618891  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1450  protein of unknown function UPF0150  33.07 
 
 
133 aa  94  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  36.15 
 
 
139 aa  92.8  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  36.72 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1551  hypothetical protein  37.8 
 
 
129 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  31.75 
 
 
124 aa  73.6  0.0000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3797  hypothetical protein  33.6 
 
 
140 aa  72  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1835  hypothetical protein  33.33 
 
 
134 aa  72  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000086332  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  40.21 
 
 
98 aa  70.5  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1837  hypothetical protein  31.34 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  31.19 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  35.61 
 
 
139 aa  63.5  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2027  protein of unknown function UPF0150  29.27 
 
 
135 aa  61.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000026815  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  44.12 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  32.81 
 
 
132 aa  51.2  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  32.82 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0019  protein of unknown function UPF0150  42.19 
 
 
93 aa  47.4  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0272418  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  32.06 
 
 
131 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  31.01 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  38.81 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5716  hypothetical protein  32.95 
 
 
139 aa  40.8  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  41.18 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  26.4 
 
 
134 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>