94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2597 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 
98 aa  196  9e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  43.82 
 
 
139 aa  85.5  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1450  protein of unknown function UPF0150  42.71 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0019  protein of unknown function UPF0150  45.78 
 
 
93 aa  82.4  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0272418  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  42.71 
 
 
138 aa  82  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3434  hypothetical protein  39.58 
 
 
137 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141009  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3513  hypothetical protein  38.54 
 
 
140 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474161  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3792  hypothetical protein  38.54 
 
 
140 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0190281  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  54.84 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3432  hypothetical protein  37.5 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000618891  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2253  hypothetical protein  40.21 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0842095  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2094  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000245077  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2027  protein of unknown function UPF0150  36.17 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000026815  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  64.44 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1551  hypothetical protein  36.17 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  50.88 
 
 
130 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  53.85 
 
 
131 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  38.46 
 
 
124 aa  60.5  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  45.76 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  33.75 
 
 
129 aa  58.2  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  45.16 
 
 
137 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  53.7 
 
 
75 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  31.58 
 
 
130 aa  54.3  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  42.11 
 
 
134 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0010  hypothetical protein  41.67 
 
 
86 aa  52.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.324673  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  53.33 
 
 
75 aa  53.1  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2448  CopG domain protein DNA-binding domain protein  34.83 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1835  hypothetical protein  32.32 
 
 
134 aa  52  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000086332  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  40.68 
 
 
70 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1837  hypothetical protein  33.33 
 
 
134 aa  52  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  34.33 
 
 
118 aa  50.8  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  42.86 
 
 
150 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  43.4 
 
 
71 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  42.55 
 
 
69 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0376  protein of unknown function UPF0150  52.17 
 
 
78 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.586857  normal  0.0103099 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0134  hypothetical protein  32.14 
 
 
132 aa  48.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501544  normal  0.0368693 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  41.82 
 
 
78 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0585  hypothetical protein  42.62 
 
 
69 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290955  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  40 
 
 
138 aa  47.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  37.68 
 
 
142 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  40.32 
 
 
136 aa  47.4  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  42.37 
 
 
75 aa  47.4  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3797  hypothetical protein  30.61 
 
 
140 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  41.51 
 
 
98 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  35.21 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  36.76 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  41.18 
 
 
67 aa  45.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  37.5 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  33.33 
 
 
134 aa  45.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  47.27 
 
 
93 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  42.11 
 
 
136 aa  46.2  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  40.38 
 
 
72 aa  45.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  37.63 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  39.06 
 
 
68 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  30 
 
 
128 aa  45.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  39.06 
 
 
68 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  46.67 
 
 
72 aa  45.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3983  hypothetical protein  37.1 
 
 
145 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.959866  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  38.1 
 
 
74 aa  44.7  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4225  MerR family transcriptional regulator  54.05 
 
 
212 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676238  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  37.93 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2369  hypothetical protein  40 
 
 
80 aa  43.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00651332  normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0600  hypothetical protein  37.7 
 
 
70 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  31.82 
 
 
131 aa  43.9  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  36.11 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1422  hypothetical protein  41.67 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.368149  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  36.84 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  38.6 
 
 
71 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  42.22 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  38.6 
 
 
71 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0560  protein of unknown function UPF0150  35.94 
 
 
154 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0719  hypothetical protein  39.68 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.08984  normal  0.0479916 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  38.89 
 
 
72 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  30.3 
 
 
145 aa  42  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1797  hypothetical protein  38.18 
 
 
74 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1435  hypothetical protein  39.66 
 
 
86 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.374935  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  32.31 
 
 
135 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  29.23 
 
 
135 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  33.96 
 
 
69 aa  41.2  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  32.5 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1857  hypothetical protein  34.92 
 
 
138 aa  41.2  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000000260993  unclonable  3.98436e-16 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2122  hypothetical protein  40.74 
 
 
72 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00580753  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  36.21 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2221  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 
145 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2208  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 
145 aa  40.8  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01406  hypothetical protein  36.67 
 
 
145 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01395  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.67 
 
 
145 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1522  hypothetical protein  36.67 
 
 
145 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2043  hypothetical protein  36.67 
 
 
145 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00057688  hitchhiker  0.0000000000000165138 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1617  DNA-binding protein  36.67 
 
 
145 aa  40.8  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1736  hypothetical protein  36.67 
 
 
145 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335135  hitchhiker  0.00000000000538292 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1008  hypothetical protein  48.84 
 
 
86 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296536  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0299  hypothetical protein  42.55 
 
 
113 aa  40.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.046828  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0670  hypothetical protein  37.25 
 
 
78 aa  40  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.720771  normal  0.417071 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>